27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0132 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0132  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  775    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0645  hypothetical protein  24.14 
 
 
396 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4293  hypothetical protein  23.95 
 
 
457 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0190  ATPase  24.1 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0718  hypothetical protein  23.24 
 
 
397 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000890529 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0552  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
555 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4941  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
555 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.963786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4991  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 
555 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4832  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 
555 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.218638  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1552  hypothetical protein  24.72 
 
 
199 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4939  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 
555 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4905  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 
555 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4993  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 
555 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0213  hypothetical protein  23.87 
 
 
408 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3606  ABC transporter related protein  32.1 
 
 
555 aa  43.9  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4627  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.1 
 
 
555 aa  43.9  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0524  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.27 
 
 
554 aa  43.9  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04232  hypothetical protein  32.1 
 
 
555 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4939  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.1 
 
 
555 aa  43.9  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5906  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.1 
 
 
555 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4990  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.1 
 
 
555 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04267  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  32.1 
 
 
555 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3665  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.1 
 
 
555 aa  43.9  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0210  hypothetical protein  23.87 
 
 
408 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  decreased coverage  0.000680857 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1121  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpX  24.15 
 
 
426 aa  43.1  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.53 
 
 
1868 aa  43.1  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0143  ATPase  24.22 
 
 
397 aa  43.1  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>