26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4293 on replicon NC_014159
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014159  Tpau_4293  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  906    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0115  ATPase  32.32 
 
 		 391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0143  ATPase  32.18 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0571  ATPase  31.29 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.195341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0190  ATPase  30.05 
 
 		 393 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2291  hypothetical protein  32.42 
 
 		 449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0718  hypothetical protein  30.88 
 
 		 397 aa  132  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890529 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0645  hypothetical protein  30.47 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0031  ATPase  29.9 
 
 		 396 aa  111  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.42307  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5052  hypothetical protein  28.64 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4542  hypothetical protein  28.12 
 
 		 412 aa  106  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.930892 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0159  hypothetical protein  29.63 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0111  hypothetical protein  30.43 
 
 		 395 aa  104  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.0000000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4994  hypothetical protein  30.71 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02770  ATPase  28.21 
 
 		 364 aa  96.3  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4863  hypothetical protein  34.9 
 
 		 204 aa  95.9  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01160  hypothetical protein  26.58 
 
 		 427 aa  93.2  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13070  hypothetical protein  29.17 
 
 		 353 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1552  hypothetical protein  32.74 
 
 		 199 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1456  hypothetical protein  27.55 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06140  hypothetical protein  29.73 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20400  hypothetical protein  26.69 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1414  hypothetical protein  28.67 
 
 		 148 aa  62.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25650  hypothetical protein  32.28 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05970  hypothetical protein  28.49 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0132  hypothetical protein  24.63 
 
 		 382 aa  53.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>