25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2291 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2291  hypothetical protein  100 
 
 
449 aa  892    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0143  ATPase  33.5 
 
 
397 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0115  ATPase  33.67 
 
 
391 aa  155  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0190  ATPase  30.98 
 
 
393 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0645  hypothetical protein  29.87 
 
 
396 aa  150  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4994  hypothetical protein  31.71 
 
 
407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0718  hypothetical protein  30.15 
 
 
397 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000890529 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01160  hypothetical protein  30.54 
 
 
427 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0031  ATPase  29.55 
 
 
396 aa  136  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.42307  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25650  hypothetical protein  34.41 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4293  hypothetical protein  32.42 
 
 
457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0111  hypothetical protein  30.1 
 
 
395 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.0000000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0571  ATPase  28.9 
 
 
461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.195341  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0159  hypothetical protein  30.86 
 
 
400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4542  hypothetical protein  29.79 
 
 
412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.930892 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02770  ATPase  28.57 
 
 
364 aa  117  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1456  hypothetical protein  27.32 
 
 
368 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5052  hypothetical protein  29.48 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20400  hypothetical protein  28.35 
 
 
393 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06140  hypothetical protein  27.62 
 
 
412 aa  100  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1552  hypothetical protein  31.87 
 
 
199 aa  82.8  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13070  hypothetical protein  27.27 
 
 
353 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20645  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4863  hypothetical protein  27.64 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05970  hypothetical protein  28.77 
 
 
416 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0132  hypothetical protein  25 
 
 
382 aa  43.9  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>