27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0571 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0571  ATPase  100 
 
 
461 aa  920    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.195341  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01160  hypothetical protein  30 
 
 
427 aa  179  9e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0718  hypothetical protein  32.71 
 
 
397 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000890529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4542  hypothetical protein  32.58 
 
 
412 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.930892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0190  ATPase  33.1 
 
 
393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0143  ATPase  31.03 
 
 
397 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0115  ATPase  33.1 
 
 
391 aa  170  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4994  hypothetical protein  33.33 
 
 
407 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0645  hypothetical protein  30.37 
 
 
396 aa  167  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5052  hypothetical protein  30.77 
 
 
412 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0159  hypothetical protein  32.18 
 
 
400 aa  156  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0111  hypothetical protein  31.09 
 
 
395 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.0000000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4293  hypothetical protein  31.29 
 
 
457 aa  133  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0031  ATPase  27.59 
 
 
396 aa  129  8.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.42307  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2291  hypothetical protein  28.9 
 
 
449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02770  ATPase  28.27 
 
 
364 aa  112  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1456  hypothetical protein  25.06 
 
 
368 aa  89.7  9e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4863  hypothetical protein  31.42 
 
 
204 aa  89.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1552  hypothetical protein  29.06 
 
 
199 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20400  hypothetical protein  26.33 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13070  hypothetical protein  25.88 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20645  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05970  hypothetical protein  26.38 
 
 
416 aa  73.6  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06140  hypothetical protein  25.05 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25650  hypothetical protein  26.88 
 
 
332 aa  60.8  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0503  hypothetical protein  23.83 
 
 
362 aa  60.5  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1415  hypothetical protein  26 
 
 
195 aa  50.8  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  37.36 
 
 
184 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>