28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1456 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1456  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  745    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13070  hypothetical protein  43.48 
 
 
353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20645  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02770  ATPase  36.64 
 
 
364 aa  200  3.9999999999999996e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06140  hypothetical protein  32.51 
 
 
412 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20400  hypothetical protein  29.81 
 
 
393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2291  hypothetical protein  27.32 
 
 
449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0190  ATPase  27.18 
 
 
393 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0645  hypothetical protein  29.37 
 
 
396 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0718  hypothetical protein  27.06 
 
 
397 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000890529 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0111  hypothetical protein  26.6 
 
 
395 aa  99.8  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.0000000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0115  ATPase  28.32 
 
 
391 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0143  ATPase  27.75 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0031  ATPase  25 
 
 
396 aa  97.1  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.42307  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0503  hypothetical protein  25.34 
 
 
362 aa  95.1  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0571  ATPase  25.06 
 
 
461 aa  89.7  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.195341  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4994  hypothetical protein  26.62 
 
 
407 aa  89.7  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01160  hypothetical protein  24.94 
 
 
427 aa  89.4  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0159  hypothetical protein  24.82 
 
 
400 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4542  hypothetical protein  24.29 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.930892 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4293  hypothetical protein  27.55 
 
 
457 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1415  hypothetical protein  30.24 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5052  hypothetical protein  25.12 
 
 
412 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4863  hypothetical protein  26.34 
 
 
204 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1414  hypothetical protein  28.36 
 
 
148 aa  60.8  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25650  hypothetical protein  24.79 
 
 
332 aa  56.2  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1552  hypothetical protein  28 
 
 
199 aa  52.8  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05970  hypothetical protein  25.83 
 
 
416 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.57 
 
 
1868 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>