28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02770 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02770  ATPase  100 
 
 		 364 aa  735    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13070  hypothetical protein  37.18 
 
 		 353 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1456  hypothetical protein  36.64 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06140  hypothetical protein  36.91 
 
 		 412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20400  hypothetical protein  25.28 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0571  ATPase  28.37 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.195341  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2291  hypothetical protein  28.57 
 
 		 449 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4293  hypothetical protein  28.21 
 
 		 457 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0503  hypothetical protein  23.4 
 
 		 362 aa  99.8  7e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0111  hypothetical protein  26.56 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.0000000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0143  ATPase  27.74 
 
 		 397 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01160  hypothetical protein  26.35 
 
 		 427 aa  93.6  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0115  ATPase  26.48 
 
 		 391 aa  89.4  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0645  hypothetical protein  25.83 
 
 		 396 aa  87  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0718  hypothetical protein  25 
 
 		 397 aa  86.7  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0190  ATPase  25.71 
 
 		 393 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4994  hypothetical protein  25.19 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4542  hypothetical protein  25.98 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.930892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5052  hypothetical protein  25.79 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1552  hypothetical protein  31.49 
 
 		 199 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0159  hypothetical protein  24.56 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1415  hypothetical protein  26.87 
 
 		 195 aa  71.6  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0031  ATPase  22.48 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.42307  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4863  hypothetical protein  27.27 
 
 		 204 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1414  hypothetical protein  20.9 
 
 		 148 aa  50.1  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  20.76 
 
 		 1868 aa  46.6  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4445  hypothetical protein  23.57 
 
 		 850 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25650  hypothetical protein  22.36 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>