29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0159 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0159  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  790    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0190  ATPase  69 
 
 		 393 aa  559  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0143  ATPase  68.75 
 
 		 397 aa  542  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0115  ATPase  68.75 
 
 		 391 aa  525  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4994  hypothetical protein  69.17 
 
 		 407 aa  527  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4542  hypothetical protein  65.61 
 
 		 412 aa  527  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.930892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5052  hypothetical protein  66.1 
 
 		 412 aa  509  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01160  hypothetical protein  58.7 
 
 		 427 aa  478  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0645  hypothetical protein  40.85 
 
 		 396 aa  277  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0718  hypothetical protein  40.84 
 
 		 397 aa  269  7e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890529 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0031  ATPase  40.2 
 
 		 396 aa  255  9e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.42307  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0111  hypothetical protein  40.05 
 
 		 395 aa  254  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.0000000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0571  ATPase  32.64 
 
 		 461 aa  166  5e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.195341  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4863  hypothetical protein  43.43 
 
 		 204 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2291  hypothetical protein  30.86 
 
 		 449 aa  133  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1552  hypothetical protein  41.18 
 
 		 199 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4293  hypothetical protein  29.63 
 
 		 457 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1456  hypothetical protein  25.56 
 
 		 368 aa  98.2  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06140  hypothetical protein  27.27 
 
 		 412 aa  97.4  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13070  hypothetical protein  26.72 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02770  ATPase  24 
 
 		 364 aa  72.4  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25650  hypothetical protein  28.7 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0503  hypothetical protein  20.2 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20400  hypothetical protein  23.1 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05970  hypothetical protein  25.87 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.14 
 
 		 1668 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.33 
 
 		 1663 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1414  hypothetical protein  23.39 
 
 		 148 aa  43.5  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1415  hypothetical protein  38.71 
 
 		 195 aa  43.5  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>