35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0143 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0115  ATPase  84.6 
 
 
391 aa  638    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0190  ATPase  83.59 
 
 
393 aa  665    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0143  ATPase  100 
 
 
397 aa  793    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4542  hypothetical protein  72.82 
 
 
412 aa  586  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.930892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5052  hypothetical protein  73.3 
 
 
412 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4994  hypothetical protein  72.75 
 
 
407 aa  554  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0159  hypothetical protein  68.25 
 
 
400 aa  521  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01160  hypothetical protein  61.63 
 
 
427 aa  513  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0645  hypothetical protein  40.61 
 
 
396 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0718  hypothetical protein  40.61 
 
 
397 aa  276  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000890529 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0111  hypothetical protein  39.44 
 
 
395 aa  248  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.0000000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0031  ATPase  36.64 
 
 
396 aa  246  6e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.42307  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0571  ATPase  31.03 
 
 
461 aa  173  5e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.195341  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2291  hypothetical protein  33.5 
 
 
449 aa  156  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4863  hypothetical protein  42.78 
 
 
204 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4293  hypothetical protein  32.18 
 
 
457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1552  hypothetical protein  39.76 
 
 
199 aa  124  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06140  hypothetical protein  27.57 
 
 
412 aa  110  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1456  hypothetical protein  27.75 
 
 
368 aa  97.8  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02770  ATPase  27.74 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20400  hypothetical protein  24.5 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13070  hypothetical protein  27.27 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20645  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25650  hypothetical protein  25.98 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1414  hypothetical protein  27.73 
 
 
148 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2550  hypothetical protein  27.01 
 
 
357 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.358793  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0503  hypothetical protein  21.32 
 
 
362 aa  50.8  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4896  hypothetical protein  23.17 
 
 
441 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.815839 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05970  hypothetical protein  25.4 
 
 
416 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  24.91 
 
 
1289 aa  47.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  27.09 
 
 
2109 aa  46.6  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.46 
 
 
1668 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1415  hypothetical protein  43.1 
 
 
195 aa  43.9  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  38 
 
 
1811 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.18 
 
 
1663 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0132  hypothetical protein  24.22 
 
 
382 aa  43.1  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>