27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0503 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0503  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  734    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1415  hypothetical protein  36.27 
 
 		 195 aa  119  7.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13070  hypothetical protein  24.4 
 
 		 353 aa  95.9  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1456  hypothetical protein  25.34 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20400  hypothetical protein  24.4 
 
 		 393 aa  88.6  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06140  hypothetical protein  23.1 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02770  ATPase  22.28 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1414  hypothetical protein  31.82 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0645  hypothetical protein  21.72 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0031  ATPase  20.51 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.42307  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0718  hypothetical protein  22.3 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0190  ATPase  21.79 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0571  ATPase  23.83 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.195341  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0111  hypothetical protein  20.1 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.0000000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01160  hypothetical protein  23.3 
 
 		 427 aa  57  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0159  hypothetical protein  20.2 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4994  hypothetical protein  22.31 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0115  ATPase  21.52 
 
 		 391 aa  53.9  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4542  hypothetical protein  20.25 
 
 		 412 aa  53.1  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.930892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0143  ATPase  21.32 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3497  primosome assembly protein PriA  27.01 
 
 		 765 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.631062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5052  hypothetical protein  20.15 
 
 		 412 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05970  hypothetical protein  23.79 
 
 		 416 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3173  primosome assembly protein PriA  26.44 
 
 		 765 aa  46.2  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1552  hypothetical protein  23.39 
 
 		 199 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3302  primosome assembly protein PriA  28.18 
 
 		 768 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.304002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3690  hypothetical protein  28.79 
 
 		 657 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000260745  normal  0.0669321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>