33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0115 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0115  ATPase  100 
 
 
391 aa  778    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0190  ATPase  87.53 
 
 
393 aa  689    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0143  ATPase  84.6 
 
 
397 aa  662    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4542  hypothetical protein  72.75 
 
 
412 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.930892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5052  hypothetical protein  73.48 
 
 
412 aa  570  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4994  hypothetical protein  73.42 
 
 
407 aa  543  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0159  hypothetical protein  68.75 
 
 
400 aa  525  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01160  hypothetical protein  62.44 
 
 
427 aa  513  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0645  hypothetical protein  41.24 
 
 
396 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0718  hypothetical protein  41.56 
 
 
397 aa  276  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000890529 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0031  ATPase  39.28 
 
 
396 aa  263  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.42307  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0111  hypothetical protein  39.74 
 
 
395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.0000000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0571  ATPase  33.1 
 
 
461 aa  177  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.195341  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2291  hypothetical protein  33.67 
 
 
449 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4863  hypothetical protein  41.75 
 
 
204 aa  150  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4293  hypothetical protein  32.32 
 
 
457 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1552  hypothetical protein  40.96 
 
 
199 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1456  hypothetical protein  28.32 
 
 
368 aa  107  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06140  hypothetical protein  27.55 
 
 
412 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20400  hypothetical protein  26.93 
 
 
393 aa  86.3  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02770  ATPase  26.48 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13070  hypothetical protein  26.76 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20645  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25650  hypothetical protein  29.46 
 
 
332 aa  82  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0503  hypothetical protein  22.03 
 
 
362 aa  60.1  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05970  hypothetical protein  26.17 
 
 
416 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2550  hypothetical protein  27.56 
 
 
357 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.358793  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1414  hypothetical protein  26.89 
 
 
148 aa  53.5  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4896  hypothetical protein  24.27 
 
 
441 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.815839 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4454  hypothetical protein  24.57 
 
 
917 aa  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  26.25 
 
 
284 aa  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  25.48 
 
 
1289 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  32.22 
 
 
1811 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1415  hypothetical protein  41.38 
 
 
195 aa  43.1  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>