15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1415 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1415  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  394  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0503  hypothetical protein  36.27 
 
 
362 aa  119  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1456  hypothetical protein  30.24 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13070  hypothetical protein  28.82 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20645  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02770  ATPase  26.87 
 
 
364 aa  71.2  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06140  hypothetical protein  21.95 
 
 
412 aa  51.2  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0571  ATPase  26 
 
 
461 aa  50.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.195341  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05970  hypothetical protein  21.76 
 
 
416 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0384  ATPase  25.95 
 
 
361 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000176931  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0111  hypothetical protein  21.6 
 
 
395 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.0000000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0143  ATPase  43.1 
 
 
397 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0159  hypothetical protein  38.71 
 
 
400 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0190  ATPase  41.38 
 
 
393 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0115  ATPase  41.38 
 
 
391 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0128  ATPase family protein  23.56 
 
 
463 aa  42.4  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000122266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>