30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0645 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0645  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  800    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0718  hypothetical protein  87.37 
 
 
397 aa  703    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000890529 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0111  hypothetical protein  52.69 
 
 
395 aa  403  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.0000000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0031  ATPase  45.36 
 
 
396 aa  319  7e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.42307  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0190  ATPase  41.28 
 
 
393 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0143  ATPase  40.61 
 
 
397 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0115  ATPase  41.24 
 
 
391 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0159  hypothetical protein  40.6 
 
 
400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1552  hypothetical protein  72.73 
 
 
199 aa  264  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4994  hypothetical protein  40.36 
 
 
407 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01160  hypothetical protein  36.43 
 
 
427 aa  252  7e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4542  hypothetical protein  37.9 
 
 
412 aa  249  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.930892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5052  hypothetical protein  37.65 
 
 
412 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4863  hypothetical protein  53 
 
 
204 aa  216  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0571  ATPase  30.37 
 
 
461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.195341  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2291  hypothetical protein  29.87 
 
 
449 aa  146  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4293  hypothetical protein  30.47 
 
 
457 aa  116  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06140  hypothetical protein  24.94 
 
 
412 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1456  hypothetical protein  29.37 
 
 
368 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13070  hypothetical protein  30.2 
 
 
353 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20645  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20400  hypothetical protein  25.75 
 
 
393 aa  79.3  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02770  ATPase  25.63 
 
 
364 aa  77  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25650  hypothetical protein  26.16 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05970  hypothetical protein  25.68 
 
 
416 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0503  hypothetical protein  21.72 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0132  hypothetical protein  24.14 
 
 
382 aa  53.5  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  21.31 
 
 
1850 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.3 
 
 
1805 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4860  hypothetical protein  30 
 
 
396 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.935426  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  23.02 
 
 
2279 aa  43.1  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>