15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4896 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4896  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  904    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.815839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0111  hypothetical protein  24.72 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.0000000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0718  hypothetical protein  25 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890529 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0031  ATPase  27.48 
 
 		 396 aa  63.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.42307  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0143  ATPase  24.43 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0190  ATPase  23.23 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4994  hypothetical protein  24.86 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0645  hypothetical protein  23.27 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0115  ATPase  24.68 
 
 		 391 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5052  hypothetical protein  25.16 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1005  hypothetical protein  22.1 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.411046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4542  hypothetical protein  23.66 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.930892 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0159  hypothetical protein  22.01 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01160  hypothetical protein  24.01 
 
 		 427 aa  43.5  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  36 
 
 		 1403 aa  43.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>