81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3354 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3354  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
187 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.47034  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1741  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0937036  normal  0.375593 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22360  hypothetical protein  34.91 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3204  GCN5-related N-acetyltransferase  33.9 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.925603  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25520  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  28.67 
 
 
172 aa  64.3  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0077  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
317 aa  62.4  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2467  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
163 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.376562  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3517  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  28.81 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1192  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 
181 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0681319  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1117  GCN5-related N-acetyltransferase  26.38 
 
 
183 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123993  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0445  hypothetical protein  32.61 
 
 
169 aa  54.7  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4461  GCN5-related N-acetyltransferase  22.28 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216912  normal  0.010687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2973  GCN5-related N-acetyltransferase  25.9 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0472391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4801  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 
182 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0368594 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
204 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329985  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  27.43 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0946  GCN5-related N-acetyltransferase  30.84 
 
 
147 aa  53.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0163773  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3043  GCN5-related N-acetyltransferase  23.3 
 
 
196 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083248  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3405  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000780456  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324183  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
197 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00275714  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01526  hypothetical protein  29.66 
 
 
182 aa  52.4  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  27.43 
 
 
182 aa  52  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3402  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 
179 aa  51.6  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.774509  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1047  GCN5-related N-acetyltransferase  27.73 
 
 
194 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000813755  hitchhiker  0.000000247911 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  28.91 
 
 
183 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4697  GCN5-related N-acetyltransferase  25.97 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  normal  0.278503 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5603  GCN5-related N-acetyltransferase  25.97 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.40665  normal  0.677013 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0961  GCN5-related N-acetyltransferase  27.64 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0164195  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  25.97 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265816  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2295  GCN5-related N-acetyltransferase  24.55 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  0.695488 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4642  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
225 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1374  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
187 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4413  GCN5-related N-acetyltransferase  29.91 
 
 
185 aa  48.9  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.275989 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2024  acetyltransferase  29.87 
 
 
210 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2004  acetyltransferase  29.87 
 
 
210 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.930496  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2160  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  29.87 
 
 
209 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003996  putative ribosomal-protein-serine acetyltransferase  28.81 
 
 
182 aa  48.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.69551  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1795  GCN5-related N-acetyltransferase  22.42 
 
 
166 aa  48.5  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.116453  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5000  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
185 aa  48.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696627  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0023  GCN5-related N-acetyltransferase  24.56 
 
 
187 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0320  GCN5-related N-acetyltransferase  22.88 
 
 
199 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.810608 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0616  acetyltransferase  21.64 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  24.06 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1571  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  21.64 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.71775  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3149  GCN5-related N-acetyltransferase  25.14 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000175005  hitchhiker  0.00000000160471 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2206  GCN5-related N-acetyltransferase  23.66 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0195  acetyltransferase  32.91 
 
 
189 aa  45.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1518  GNAT family acetyltransferase  26.5 
 
 
181 aa  45.4  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000034512  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  25.2 
 
 
376 aa  45.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3593  GCN5-related N-acetyltransferase  25.89 
 
 
179 aa  45.1  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  27.19 
 
 
196 aa  45.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2385  acetyltransferase, GNAT family  24.57 
 
 
203 aa  44.7  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.186959 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
205 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3234  GCN5-related N-acetyltransferase  21.98 
 
 
185 aa  45.1  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.812854  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0871  GCN5-related N-acetyltransferase  28.07 
 
 
175 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5042  GCN5-related N-acetyltransferase  25.22 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.445888 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2752  acetyltransferase  24.06 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5249  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23000  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  26.74 
 
 
380 aa  44.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.713177  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  24.32 
 
 
189 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.684  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  26.72 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0259  GCN5-related N-acetyltransferase  28.71 
 
 
143 aa  44.3  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0999  GCN5-related N-acetyltransferase  27.96 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303176  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3089  GCN5-related N-acetyltransferase  23.31 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.482966  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0216  GCN5-related N-acetyltransferase  24.61 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0396895  hitchhiker  0.00492608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3804  hypothetical protein  23.2 
 
 
188 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0689439  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2854  GCN5-related N-acetyltransferase  27.16 
 
 
169 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.931965  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05830  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  29.17 
 
 
172 aa  42.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6513  GCN5-related N-acetyltransferase  23.33 
 
 
185 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00143605  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  23.93 
 
 
185 aa  42  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  21.19 
 
 
185 aa  41.6  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5745  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
173 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4559  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
173 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3809  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
173 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20327  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2506  acetyltransferase-like  23.5 
 
 
191 aa  41.6  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.219044  normal  0.689211 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0205  GNAT family acetyltransferase  26.67 
 
 
197 aa  41.6  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5544  hypothetical protein  22.81 
 
 
174 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.073963 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3126  acetyltransferase  26.96 
 
 
181 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.731723  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
200 aa  41.2  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>