35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25520 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_25520  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  100 
 
 
172 aa  338  2.9999999999999998e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22360  hypothetical protein  63.96 
 
 
111 aa  142  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1741  GCN5-related N-acetyltransferase  51.28 
 
 
184 aa  136  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0937036  normal  0.375593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2467  GCN5-related N-acetyltransferase  49.34 
 
 
163 aa  134  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.376562  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3354  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.47034  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22350  hypothetical protein  58.54 
 
 
50 aa  55.5  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1192  GCN5-related N-acetyltransferase  30.52 
 
 
181 aa  54.3  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0681319  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0083  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
176 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0457106  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3937  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 
177 aa  48.5  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0592305  normal  0.264283 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23000  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  30.34 
 
 
380 aa  48.1  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.713177  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  25.62 
 
 
186 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0244  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
184 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  30.38 
 
 
193 aa  47.4  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2507  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
167 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000414368  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0585  GCN5-related N-acetyltransferase  25.53 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.424519  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  30.56 
 
 
359 aa  45.8  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  29.19 
 
 
183 aa  45.1  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
207 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1494  GCN5-related N-acetyltransferase  24.14 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0023  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
194 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4586  GCN5-related N-acetyltransferase  32.05 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2841  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  25.32 
 
 
881 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1628  CoA-binding domain protein  26.49 
 
 
821 aa  42  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2859  acetyltransferase, GNAT family  22.38 
 
 
168 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464219 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3625  hypothetical protein  26.45 
 
 
176 aa  41.6  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  22.42 
 
 
915 aa  41.2  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
890 aa  41.2  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13180  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  27.04 
 
 
909 aa  40.8  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.135541  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2043  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
198 aa  41.2  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.221782 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3284  acetyltransferase, GNAT family  22.14 
 
 
168 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>