59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6369 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6369  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  100 
 
 		 646 aa  1320    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2500  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  54.93 
 
 		 628 aa  623  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8138  Negative regulator of beta-lactamase expression- like protein  52.09 
 
 		 646 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215113  normal  0.487089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6273  Negative regulator of beta-lactamase expression- like protein  49.25 
 
 		 666 aa  529  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297593  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2101  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  44.59 
 
 		 638 aa  489  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000444895  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2270  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  40.26 
 
 		 748 aa  426  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000172268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.75 
 
 		 477 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204427  normal  0.0325548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3587  Negative regulator of beta-lactamase expression- like protein  35.01 
 
 		 467 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115346  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3389  Negative regulator of beta-lactamase expression- like protein  37.05 
 
 		 480 aa  210  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7871  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.09 
 
 		 508 aa  207  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2196  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  37.34 
 
 		 490 aa  205  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.800961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5368  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  34.35 
 
 		 589 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.621632  normal  0.350782 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3112  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  34.87 
 
 		 496 aa  196  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1933  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  35.11 
 
 		 330 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6415  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  24 
 
 		 551 aa  75.5  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2966  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  32.89 
 
 		 242 aa  62.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000101487  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0865  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  28.83 
 
 		 321 aa  62  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.817413  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1062  negative regulator of beta-lactamase expression-like protein  28.39 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0213  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  30.18 
 
 		 194 aa  54.3  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.815893 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2942  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  28.21 
 
 		 203 aa  52.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.086172  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3089  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  28.06 
 
 		 200 aa  52.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2940  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  27.38 
 
 		 181 aa  51.6  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.434032 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0865  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  28.49 
 
 		 209 aa  51.2  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.27665  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4820  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  29.87 
 
 		 236 aa  50.4  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0627398  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0249  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  27.98 
 
 		 189 aa  49.7  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0421  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  31.09 
 
 		 181 aa  49.3  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0423  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  32.77 
 
 		 181 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000285307  normal  0.0465773 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4811  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  32.38 
 
 		 189 aa  48.9  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0381  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  30.13 
 
 		 209 aa  48.5  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0550988 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0521  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  31.58 
 
 		 196 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5108  normal  0.316585 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2806  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  28.05 
 
 		 200 aa  48.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.601982 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1087  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  29.59 
 
 		 175 aa  48.1  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243154  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2627  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  28.74 
 
 		 183 aa  48.1  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1812  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  30.81 
 
 		 181 aa  48.1  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2589  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  29.94 
 
 		 184 aa  47.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2219  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  29.94 
 
 		 184 aa  47.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.492411  normal  0.481949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4057  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  26.92 
 
 		 288 aa  47.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.100978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2790  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  31.58 
 
 		 196 aa  47  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.715345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0496  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  31.58 
 
 		 196 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2640  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  32.31 
 
 		 212 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2928  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  27.87 
 
 		 426 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3434  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  31.3 
 
 		 184 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.168463  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1109  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  29.07 
 
 		 201 aa  46.6  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158136  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0829  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.01 
 
 		 397 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0425  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  32.5 
 
 		 179 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3602  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  32.5 
 
 		 179 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.288679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0872  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.4 
 
 		 348 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4374  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  30.52 
 
 		 249 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0600815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0372  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  25.93 
 
 		 190 aa  44.7  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.672773  hitchhiker  0.000087686 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2641  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  27.38 
 
 		 198 aa  44.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0817  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  29.27 
 
 		 182 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0889855  normal  0.17457 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3386  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  30.08 
 
 		 193 aa  44.3  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1916  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  25.1 
 
 		 219 aa  44.3  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03228  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  29.52 
 
 		 178 aa  44.3  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0876  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  27.84 
 
 		 199 aa  43.9  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.116564  normal  0.0226174 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0954  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  28.99 
 
 		 203 aa  43.9  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1366  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  28.49 
 
 		 189 aa  43.9  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0669  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  26.95 
 
 		 188 aa  43.9  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3051  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  27.38 
 
 		 198 aa  43.9  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>