58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6273 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8138  Negative regulator of beta-lactamase expression- like protein  60.49 
 
 		 646 aa  697    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215113  normal  0.487089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6273  Negative regulator of beta-lactamase expression- like protein  100 
 
 		 666 aa  1331    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297593  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2500  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  52.79 
 
 		 628 aa  566  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6369  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  49.84 
 
 		 646 aa  529  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2101  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  45.15 
 
 		 638 aa  464  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000444895  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2270  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  41.23 
 
 		 748 aa  442  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000172268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3587  Negative regulator of beta-lactamase expression- like protein  38.48 
 
 		 467 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115346  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3389  Negative regulator of beta-lactamase expression- like protein  37.93 
 
 		 480 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.3 
 
 		 477 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204427  normal  0.0325548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7871  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.44 
 
 		 508 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2196  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  35.42 
 
 		 490 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.800961  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3112  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  37.56 
 
 		 496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5368  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  35.37 
 
 		 589 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.621632  normal  0.350782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1933  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  36.46 
 
 		 330 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6415  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  26.2 
 
 		 551 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0865  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  32.08 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.817413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0865  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  32.74 
 
 		 209 aa  53.5  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.27665  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4944  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.21 
 
 		 301 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.038406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0213  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  31.05 
 
 		 194 aa  51.6  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.815893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3089  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  28.4 
 
 		 200 aa  50.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3780  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 		 184 aa  50.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2966  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  29.07 
 
 		 242 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000101487  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1497  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  31.55 
 
 		 199 aa  49.3  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2940  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  32.23 
 
 		 181 aa  49.7  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.434032 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3386  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  32.8 
 
 		 193 aa  48.9  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2942  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  28.91 
 
 		 203 aa  47.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.086172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0963  hypothetical protein  36.59 
 
 		 579 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0372  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  29.92 
 
 		 190 aa  47.4  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.672773  hitchhiker  0.000087686 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0421  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  31.67 
 
 		 181 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0829  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.59 
 
 		 397 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0423  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  32.5 
 
 		 181 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000285307  normal  0.0465773 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0777  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.62 
 
 		 567 aa  47  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1109  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  28.36 
 
 		 201 aa  47.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2640  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  31.82 
 
 		 212 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0777  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.59 
 
 		 579 aa  47  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00112193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0962  hypothetical protein  36.59 
 
 		 579 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.62 
 
 		 567 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032251 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0925  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.62 
 
 		 572 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3437  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  31.82 
 
 		 198 aa  46.6  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0209921  hitchhiker  0.000481483 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0872  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.59 
 
 		 348 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5098  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  28.85 
 
 		 271 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.179835 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0249  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  31.82 
 
 		 189 aa  46.2  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0428  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  32.48 
 
 		 205 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.935847  hitchhiker  0.000848946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4057  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  31.65 
 
 		 288 aa  45.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.100978  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1916  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  30.94 
 
 		 219 aa  45.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3434  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  32.48 
 
 		 184 aa  45.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.168463  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4811  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  30.95 
 
 		 189 aa  45.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1050  hypothetical protein  35.37 
 
 		 578 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2350  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  28.57 
 
 		 304 aa  45.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.568206 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0147  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.1 
 
 		 262 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0103  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  32 
 
 		 183 aa  44.3  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0113  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  32 
 
 		 183 aa  44.3  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.933893  normal  0.409809 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2790  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  29.56 
 
 		 196 aa  44.3  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.715345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0519  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  31.25 
 
 		 198 aa  44.3  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3602  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  32.23 
 
 		 179 aa  43.9  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.288679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3859  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  32.5 
 
 		 187 aa  43.9  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000140169 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0521  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  29.56 
 
 		 196 aa  43.9  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5108  normal  0.316585 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0425  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  32.23 
 
 		 179 aa  43.9  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>