100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4243 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4243  asparagine synthase  100 
 
 
630 aa  1243    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6316  asparagine synthase  36.76 
 
 
609 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4486  asparagine synthase  31.91 
 
 
564 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2103  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  33.63 
 
 
351 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.291589 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14520  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.39 
 
 
507 aa  89.7  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1145  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  28.43 
 
 
610 aa  88.6  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2986  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  30.12 
 
 
611 aa  87.8  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.524565  normal  0.15701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3327  asparagine synthase  29.68 
 
 
599 aa  87.4  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.871643  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1153  asparagine synthase  22.3 
 
 
659 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1965  asparagine synthase  27.7 
 
 
624 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595077  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5791  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.32 
 
 
627 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.84 
 
 
634 aa  68.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.21 
 
 
646 aa  67.8  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2515  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  26.86 
 
 
643 aa  66.6  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0685531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2557  putative asparagine synthetase  24.41 
 
 
626 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1216  asparagine synthase  24.41 
 
 
626 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.108525  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.97 
 
 
628 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6500  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.66 
 
 
638 aa  65.1  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2388  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.46 
 
 
627 aa  63.9  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.9 
 
 
629 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411872  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0186  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  21.85 
 
 
583 aa  62.4  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3607  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  23.73 
 
 
615 aa  62.4  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  22.6 
 
 
632 aa  60.8  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0901  hypothetical protein  19.46 
 
 
603 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.34209 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0508  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.19 
 
 
626 aa  58.9  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0497  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.47 
 
 
630 aa  58.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0431896  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0146  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.11 
 
 
652 aa  57.8  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0090  asparagine synthase  28.03 
 
 
633 aa  57.4  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1324  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  19.77 
 
 
622 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.174178  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0254  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.29 
 
 
622 aa  57  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2884  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.05 
 
 
646 aa  56.6  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.05 
 
 
629 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1353  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.41 
 
 
632 aa  55.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.1901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.49 
 
 
629 aa  55.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2066  asparagine synthase  24.34 
 
 
580 aa  54.7  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0480532  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1915  asparagine synthase  24.53 
 
 
533 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2668  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.76 
 
 
629 aa  54.3  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0183361  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0058  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  21.78 
 
 
629 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0050  asparagine synthase  29.49 
 
 
636 aa  53.9  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1965  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.05 
 
 
607 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1902  asparagine synthase  24.34 
 
 
531 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2466  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.88 
 
 
625 aa  52  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1975  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.83 
 
 
643 aa  52  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1953  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.67 
 
 
611 aa  52  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2428  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  28.97 
 
 
555 aa  51.6  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0680339  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3272  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.91 
 
 
654 aa  51.2  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.55 
 
 
619 aa  50.8  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3531  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.29 
 
 
596 aa  50.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0213452  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0134  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.65 
 
 
618 aa  50.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2520  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.21 
 
 
620 aa  50.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0134172 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0683  asparagine synthase  32.84 
 
 
582 aa  50.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0665  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  24.11 
 
 
623 aa  49.7  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0824019  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4315  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.95 
 
 
658 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0573  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.49 
 
 
609 aa  48.5  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4548  asparagine synthase  25.32 
 
 
751 aa  48.5  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84734  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33380  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.5 
 
 
512 aa  48.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.505962 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0960  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  19.54 
 
 
617 aa  48.1  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0819  asparagine synthase  24.13 
 
 
653 aa  47.8  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3988  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.93 
 
 
656 aa  47.8  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0858  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.64 
 
 
655 aa  47.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0472  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25.22 
 
 
624 aa  47.4  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5441  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.17 
 
 
656 aa  47.4  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277238  normal  0.0334078 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1919  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  37.38 
 
 
631 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.89 
 
 
633 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641496  normal  0.029694 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0346  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.24 
 
 
610 aa  47  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2439  asparagine synthase  24.6 
 
 
582 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0380911  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22410  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  20.17 
 
 
484 aa  47  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3398  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.05 
 
 
594 aa  47  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108074  normal  0.978255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1346  asparagine synthase  29.06 
 
 
639 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2519  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  22.96 
 
 
647 aa  46.2  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.828783  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2293  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.76 
 
 
593 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00195658  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3265  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.02 
 
 
614 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0032  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.39 
 
 
672 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.579611 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2408  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  22.32 
 
 
635 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0905  asparagine synthetase family protein  25.35 
 
 
637 aa  46.2  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1202  hypothetical protein  27.3 
 
 
469 aa  46.6  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0441787  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1110  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.35 
 
 
637 aa  46.2  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4005  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.89 
 
 
622 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1615  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36 
 
 
620 aa  45.8  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0308  asparagine synthase  27.3 
 
 
422 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611476  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0967  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.59 
 
 
676 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1646  hypothetical protein  27.3 
 
 
422 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238997  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4250  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.12 
 
 
619 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.210666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4478  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.1 
 
 
666 aa  45.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.48246  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0595  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  23.72 
 
 
602 aa  45.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.957745  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4494  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.51 
 
 
610 aa  45.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210127  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4334  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.21 
 
 
645 aa  45.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969348  decreased coverage  0.00494377 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  24.51 
 
 
482 aa  45.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3071  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.51 
 
 
612 aa  44.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  23.83 
 
 
537 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0292  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.46 
 
 
639 aa  44.7  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.216365  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2442  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25 
 
 
607 aa  44.7  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3523  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.81 
 
 
656 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.848758  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4843  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.81 
 
 
656 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0921814  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0671  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.49 
 
 
619 aa  44.3  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4439  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.96 
 
 
634 aa  44.3  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3175  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25.46 
 
 
643 aa  44.3  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2024  asparagine synthase  30.51 
 
 
656 aa  43.9  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.636967 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.69 
 
 
664 aa  43.9  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2172  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  23.61 
 
 
665 aa  43.9  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.71793  hitchhiker  0.0000206838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>