More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0819 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0819  asparagine synthase  100 
 
 
653 aa  1304    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2340  asparagine synthase  29.92 
 
 
649 aa  257  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.139025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1346  asparagine synthase  32.24 
 
 
639 aa  242  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3386  asparagine synthase  27.41 
 
 
645 aa  233  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.320391  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3272  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.63 
 
 
654 aa  225  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1351  asparagine synthase  30.56 
 
 
640 aa  220  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0855  asparagine synthase  32.95 
 
 
644 aa  211  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.434854  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0967  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.56 
 
 
676 aa  196  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1279  asparagine synthase  27.93 
 
 
642 aa  172  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3028  asparagine synthase  29.37 
 
 
592 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3241  asparagine synthase  27.46 
 
 
649 aa  151  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2884  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.52 
 
 
646 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4904  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.05 
 
 
613 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0220651  normal  0.122286 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.93 
 
 
629 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0712  putative asparagine synthetase  32.88 
 
 
626 aa  145  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2657  asparagine synthase  23.96 
 
 
639 aa  144  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0825967  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4548  asparagine synthase  30.57 
 
 
751 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84734  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1460  asparagine synthase  29.39 
 
 
634 aa  140  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2557  putative asparagine synthetase  30.66 
 
 
626 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1153  asparagine synthase  26.53 
 
 
659 aa  140  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.22 
 
 
678 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5791  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.66 
 
 
627 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1216  asparagine synthase  30.46 
 
 
626 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.108525  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1119  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing  24.1 
 
 
632 aa  136  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0896  asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]  24.1 
 
 
632 aa  136  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2515  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  28.42 
 
 
643 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0685531 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0200  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.36 
 
 
655 aa  133  9e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2408  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.54 
 
 
635 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.04 
 
 
632 aa  131  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0959  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.3 
 
 
635 aa  130  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0230  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.08 
 
 
658 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.18 
 
 
629 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.91 
 
 
646 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.08 
 
 
664 aa  127  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0050  asparagine synthase  31.94 
 
 
636 aa  127  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4334  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.13 
 
 
645 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969348  decreased coverage  0.00494377 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2466  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.19 
 
 
625 aa  126  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1965  asparagine synthase  29.26 
 
 
624 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595077  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0542  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.62 
 
 
606 aa  126  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0355  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.72 
 
 
636 aa  125  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1962  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.27 
 
 
667 aa  125  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.16588  hitchhiker  0.0019144 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0536  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.81 
 
 
662 aa  124  5e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3533  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  24.2 
 
 
621 aa  124  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1026  asparagine synthase  24.44 
 
 
617 aa  123  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.258049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5966  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.18 
 
 
893 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111384  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0353  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.36 
 
 
611 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0524  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.82 
 
 
595 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0669  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.2 
 
 
641 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0125  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.78 
 
 
571 aa  121  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0292  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.16 
 
 
639 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.216365  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.35 
 
 
634 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2057  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.67 
 
 
603 aa  120  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.825399  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1501  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.78 
 
 
614 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.58 
 
 
666 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2339  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.87 
 
 
639 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.795917  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2388  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.83 
 
 
627 aa  118  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2724  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.95 
 
 
621 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10450  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  24.33 
 
 
938 aa  117  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00957139  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1975  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.15 
 
 
643 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1512  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.49 
 
 
637 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0764  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.39 
 
 
663 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181606 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.44 
 
 
619 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4478  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.53 
 
 
666 aa  114  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.48246  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1938  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.82 
 
 
639 aa  114  7.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1539  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.61 
 
 
611 aa  113  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3751  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.25 
 
 
655 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4315  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.17 
 
 
658 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1756  asparagine synthase family amidotransferase  34.84 
 
 
594 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1615  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.4 
 
 
620 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1081  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.56 
 
 
660 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.82 
 
 
660 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0858  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.14 
 
 
655 aa  112  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.43 
 
 
628 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4960  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.11 
 
 
598 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3403  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.17 
 
 
624 aa  110  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0138  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.46 
 
 
631 aa  110  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0809158  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0472  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  34.26 
 
 
624 aa  109  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1407  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.17 
 
 
607 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.508738  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2442  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.27 
 
 
607 aa  109  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2127  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  29.37 
 
 
605 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0186  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  23.09 
 
 
583 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3035  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.14 
 
 
882 aa  109  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.608951  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0461  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.65 
 
 
613 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3261  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.28 
 
 
671 aa  108  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.5853  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1577  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.74 
 
 
607 aa  108  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.702633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1767  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.61 
 
 
607 aa  108  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3523  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.53 
 
 
656 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.848758  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4843  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.53 
 
 
656 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0921814  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2280  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  27.33 
 
 
605 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000628708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  27.33 
 
 
633 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  27.33 
 
 
633 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  27.33 
 
 
633 aa  107  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  27.33 
 
 
633 aa  107  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  27.33 
 
 
633 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  27.33 
 
 
633 aa  107  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  27.33 
 
 
633 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4419  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.37 
 
 
665 aa  107  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  27.33 
 
 
633 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1625  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.74 
 
 
607 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.462757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1751  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.74 
 
 
607 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00305862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>