More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2657 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2657  asparagine synthase  100 
 
 
639 aa  1327    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0825967  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0967  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.88 
 
 
676 aa  187  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3386  asparagine synthase  26.32 
 
 
645 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.320391  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0050  asparagine synthase  26.8 
 
 
636 aa  182  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1351  asparagine synthase  27.74 
 
 
640 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2340  asparagine synthase  24.55 
 
 
649 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.139025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1346  asparagine synthase  26.04 
 
 
639 aa  171  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3272  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.89 
 
 
654 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1216  asparagine synthase  27.06 
 
 
626 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.108525  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2557  putative asparagine synthetase  26.88 
 
 
626 aa  163  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4548  asparagine synthase  27.5 
 
 
751 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84734  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0855  asparagine synthase  25.18 
 
 
644 aa  148  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.434854  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0819  asparagine synthase  23.96 
 
 
653 aa  144  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1965  asparagine synthase  25.86 
 
 
624 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595077  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2442  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.05 
 
 
607 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4904  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.78 
 
 
613 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0220651  normal  0.122286 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1501  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.66 
 
 
614 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1460  asparagine synthase  25.34 
 
 
634 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2952  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.23 
 
 
609 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.101456  normal  0.924945 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1407  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.18 
 
 
607 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.508738  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0690  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.47 
 
 
615 aa  117  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.63 
 
 
678 aa  117  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1539  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.65 
 
 
611 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  23.04 
 
 
632 aa  117  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1962  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.14 
 
 
667 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.16588  hitchhiker  0.0019144 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2057  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.84 
 
 
603 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.825399  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0671  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  22.77 
 
 
619 aa  115  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403127  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.99 
 
 
634 aa  115  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2829  asparagine synthase  24.49 
 
 
654 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.74 
 
 
664 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  21.96 
 
 
629 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1026  asparagine synthase  24.05 
 
 
617 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.258049 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1153  asparagine synthase  24.25 
 
 
659 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3533  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  22.55 
 
 
621 aa  109  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3261  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.66 
 
 
671 aa  108  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.5853  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.13 
 
 
629 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0254  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.1 
 
 
622 aa  107  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0353  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.38 
 
 
611 aa  106  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5684  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.55 
 
 
607 aa  106  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.195642  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.74 
 
 
590 aa  106  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0058  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  22.41 
 
 
629 aa  105  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1828  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  24.23 
 
 
607 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.433581  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0355  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.14 
 
 
636 aa  104  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.17 
 
 
666 aa  104  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3035  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.36 
 
 
882 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.608951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1625  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.02 
 
 
607 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.786929  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4478  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.21 
 
 
666 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.48246  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0568  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.54 
 
 
647 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591959  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1882  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.82 
 
 
560 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.366504  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3028  asparagine synthase  25.19 
 
 
592 aa  101  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0712  putative asparagine synthetase  31.74 
 
 
626 aa  101  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2388  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.63 
 
 
627 aa  100  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3652  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  22.99 
 
 
595 aa  100  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.27 
 
 
629 aa  100  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1625  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  23.61 
 
 
607 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.462757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1586  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  23.61 
 
 
607 aa  99.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000166408  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1512  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  21.96 
 
 
637 aa  100  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1751  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  23.61 
 
 
607 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00305862  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0524  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.29 
 
 
595 aa  99.8  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4039  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.4 
 
 
633 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354675  normal  0.528504 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3575  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  23.41 
 
 
607 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2826  asparagine synthase  23.82 
 
 
662 aa  98.6  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0872  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  20.96 
 
 
618 aa  97.8  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0025755  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1652  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.19 
 
 
633 aa  97.1  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000197095  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2280  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  29.72 
 
 
605 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000628708  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.43 
 
 
634 aa  97.1  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  29.72 
 
 
633 aa  97.1  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  29.72 
 
 
633 aa  97.1  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  29.72 
 
 
633 aa  97.1  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2387  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.36 
 
 
655 aa  97.1  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  29.72 
 
 
633 aa  97.1  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  29.72 
 
 
633 aa  97.1  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  29.72 
 
 
633 aa  97.1  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  29.72 
 
 
633 aa  97.1  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  29.72 
 
 
633 aa  97.1  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.72 
 
 
633 aa  96.3  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4315  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.52 
 
 
658 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4419  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.29 
 
 
665 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1767  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  22.75 
 
 
607 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5791  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.57 
 
 
627 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.71 
 
 
646 aa  96.3  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3403  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  21.86 
 
 
624 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3241  asparagine synthase  21.24 
 
 
649 aa  95.1  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0556  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.24 
 
 
613 aa  94.7  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.464828  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2466  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  21.9 
 
 
625 aa  94.7  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0959  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.17 
 
 
635 aa  94.4  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4066  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.33 
 
 
601 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1505  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.94 
 
 
615 aa  92.8  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2884  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.54 
 
 
646 aa  91.3  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0114  asparagine synthase family amidotransferase  23.28 
 
 
592 aa  91.7  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4334  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.57 
 
 
645 aa  91.3  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969348  decreased coverage  0.00494377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1389  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  21.88 
 
 
625 aa  91.3  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0764  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.55 
 
 
663 aa  91.3  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181606 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1627  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.15 
 
 
615 aa  90.9  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0896  asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]  29.68 
 
 
632 aa  91.3  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1119  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing  29.68 
 
 
632 aa  90.9  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1081  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.39 
 
 
660 aa  91.3  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0163  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  22.68 
 
 
601 aa  90.1  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2276  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.72 
 
 
601 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.315443  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2461  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.16 
 
 
593 aa  89.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>