More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3028 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3028  asparagine synthase  100 
 
 
592 aa  1172    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0855  asparagine synthase  34.69 
 
 
644 aa  231  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.434854  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3241  asparagine synthase  30.14 
 
 
649 aa  213  9e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1279  asparagine synthase  30.86 
 
 
642 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2340  asparagine synthase  26.29 
 
 
649 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.139025 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0819  asparagine synthase  29.37 
 
 
653 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3272  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25 
 
 
654 aa  160  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1351  asparagine synthase  28.08 
 
 
640 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3386  asparagine synthase  23.64 
 
 
645 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.320391  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1460  asparagine synthase  32.03 
 
 
634 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1346  asparagine synthase  27.47 
 
 
639 aa  141  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0967  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.54 
 
 
676 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1026  asparagine synthase  29.43 
 
 
617 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.258049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4904  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.82 
 
 
613 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0220651  normal  0.122286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2657  asparagine synthase  23.23 
 
 
639 aa  109  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0825967  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2952  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.65 
 
 
609 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.101456  normal  0.924945 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4548  asparagine synthase  31.1 
 
 
751 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84734  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1965  asparagine synthase  29.37 
 
 
624 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595077  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0050  asparagine synthase  24.66 
 
 
636 aa  92.8  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2557  putative asparagine synthetase  26.14 
 
 
626 aa  90.9  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2826  asparagine synthase  30.23 
 
 
662 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1216  asparagine synthase  26.78 
 
 
626 aa  87.8  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.108525  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0058  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  24.73 
 
 
629 aa  85.5  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2121  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.47 
 
 
653 aa  83.6  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.973734  normal  0.744167 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2829  asparagine synthase  27.11 
 
 
654 aa  82  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1153  asparagine synthase  28.82 
 
 
659 aa  80.5  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2461  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.77 
 
 
593 aa  79.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828988  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.65 
 
 
629 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411872  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3607  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  21.93 
 
 
615 aa  78.2  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10450  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  23.59 
 
 
938 aa  77.4  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00957139  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1389  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.55 
 
 
625 aa  77.4  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  19.69 
 
 
634 aa  77  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.66 
 
 
628 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.56 
 
 
629 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2388  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.19 
 
 
627 aa  75.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.19 
 
 
629 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4005  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.23 
 
 
622 aa  74.7  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4478  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.26 
 
 
666 aa  73.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.48246  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3121  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.7 
 
 
641 aa  73.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205444  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.69 
 
 
592 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00640  potential phenazine-modifying enzyme  29.79 
 
 
610 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1611  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.01 
 
 
600 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1512  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.67 
 
 
637 aa  72.4  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.05 
 
 
666 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1975  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.76 
 
 
643 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2864  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.43 
 
 
678 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.113141  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3071  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.55 
 
 
612 aa  71.2  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0542  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25.46 
 
 
606 aa  70.9  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0254  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.98 
 
 
622 aa  70.9  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1324  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  21.72 
 
 
622 aa  70.5  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.174178  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37560  asparagine synthetase, glutamine-hydrolysing  30.95 
 
 
610 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.761947  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1625  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25 
 
 
607 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.786929  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4494  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.61 
 
 
610 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210127  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2466  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.66 
 
 
625 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3035  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.23 
 
 
882 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.608951  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.73 
 
 
664 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2956  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.89 
 
 
678 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6999  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.2 
 
 
609 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655968  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0114  asparagine synthase family amidotransferase  29.12 
 
 
592 aa  69.7  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4439  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.19 
 
 
634 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0355  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25 
 
 
636 aa  68.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.41 
 
 
660 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0793  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.77 
 
 
639 aa  68.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.716028 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1802  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  24.53 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1577  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25 
 
 
607 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.702633  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.05 
 
 
619 aa  67.8  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0125  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.05 
 
 
571 aa  67.8  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1625  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25 
 
 
607 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.462757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1751  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25 
 
 
607 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00305862  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0524  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  18.76 
 
 
595 aa  67.4  0.0000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3261  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  21.59 
 
 
671 aa  67  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.5853  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2884  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.64 
 
 
646 aa  67  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4250  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.98 
 
 
619 aa  67  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.210666 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3068  asparagine synthase  29.89 
 
 
611 aa  67  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0860  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.7 
 
 
594 aa  66.6  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0424562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5624  putative asparagine synthetase  32.89 
 
 
656 aa  67  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.622425  normal  0.579265 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.13 
 
 
632 aa  66.6  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0671  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25 
 
 
619 aa  66.6  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1882  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.5 
 
 
560 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.366504  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0896  asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]  21.26 
 
 
632 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3062  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.02 
 
 
646 aa  66.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389146  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5099  asparagine synthase family amidotransferase  28.73 
 
 
594 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1275  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.26 
 
 
650 aa  66.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.157776  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0568  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.67 
 
 
647 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591959  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4334  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.89 
 
 
645 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969348  decreased coverage  0.00494377 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0595  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.94 
 
 
602 aa  65.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.957745  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1749  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.88 
 
 
656 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1119  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing  21.26 
 
 
632 aa  65.9  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3533  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  22.09 
 
 
621 aa  65.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1828  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25.14 
 
 
607 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.433581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6500  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.8 
 
 
638 aa  65.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0060  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.07 
 
 
588 aa  65.1  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.58042 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3751  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.73 
 
 
655 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5298  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.57 
 
 
629 aa  65.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.634266  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2339  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.68 
 
 
639 aa  65.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.795917  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0712  putative asparagine synthetase  23.25 
 
 
626 aa  65.1  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1953  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  22.51 
 
 
611 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0905  asparagine synthetase family protein  26.7 
 
 
637 aa  65.1  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1110  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.7 
 
 
637 aa  65.1  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5966  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.72 
 
 
893 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111384  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>