More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0967 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0967  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  100 
 
 
676 aa  1372    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2340  asparagine synthase  28.22 
 
 
649 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.139025 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3272  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.74 
 
 
654 aa  228  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3386  asparagine synthase  29.09 
 
 
645 aa  224  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.320391  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1346  asparagine synthase  33.98 
 
 
639 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2952  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.03 
 
 
609 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.101456  normal  0.924945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1351  asparagine synthase  33.02 
 
 
640 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4548  asparagine synthase  28.99 
 
 
751 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84734  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0819  asparagine synthase  33.56 
 
 
653 aa  196  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0355  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.5 
 
 
636 aa  194  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4904  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.78 
 
 
613 aa  190  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0220651  normal  0.122286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2657  asparagine synthase  24.88 
 
 
639 aa  187  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0825967  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2557  putative asparagine synthetase  30.23 
 
 
626 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2461  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.37 
 
 
593 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828988  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0050  asparagine synthase  34.93 
 
 
636 aa  180  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1216  asparagine synthase  31.25 
 
 
626 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.108525  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2057  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.65 
 
 
603 aa  177  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.825399  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1153  asparagine synthase  26.97 
 
 
659 aa  177  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2388  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.1 
 
 
627 aa  177  7e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0959  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.73 
 
 
635 aa  177  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4419  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.79 
 
 
665 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1026  asparagine synthase  33.44 
 
 
617 aa  173  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.258049 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1965  asparagine synthase  29.34 
 
 
624 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595077  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4494  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.18 
 
 
610 aa  169  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210127  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2826  asparagine synthase  35.22 
 
 
662 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0712  putative asparagine synthetase  30.81 
 
 
626 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.12 
 
 
632 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.63 
 
 
629 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0896  asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]  30.89 
 
 
632 aa  164  6e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.16 
 
 
629 aa  163  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.38 
 
 
634 aa  163  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1512  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.81 
 
 
637 aa  162  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.51 
 
 
646 aa  162  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0114  asparagine synthase family amidotransferase  29.62 
 
 
592 aa  162  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1119  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing  30.57 
 
 
632 aa  162  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0742  asparagine synthase family amidotransferase  30.91 
 
 
592 aa  161  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.3 
 
 
664 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2466  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.96 
 
 
625 aa  159  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.36 
 
 
590 aa  158  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0568  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.58 
 
 
647 aa  158  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591959  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0961  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.1 
 
 
628 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3652  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.86 
 
 
595 aa  157  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1975  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.95 
 
 
643 aa  156  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2884  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.32 
 
 
646 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0671  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.7 
 
 
619 aa  154  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1615  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.18 
 
 
620 aa  153  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2442  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.2 
 
 
607 aa  151  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0764  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.42 
 
 
663 aa  151  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181606 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1259  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25.43 
 
 
615 aa  150  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3121  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.65 
 
 
641 aa  150  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205444  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2829  asparagine synthase  32.43 
 
 
654 aa  150  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3874  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.88 
 
 
632 aa  150  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2680  asparagine synthase amidotransferase  30.95 
 
 
590 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0122276  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0595  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.63 
 
 
602 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.957745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1962  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.72 
 
 
667 aa  148  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.16588  hitchhiker  0.0019144 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1207  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25.34 
 
 
615 aa  148  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0454357  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5791  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.46 
 
 
627 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5966  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.88 
 
 
893 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111384  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0855  asparagine synthase  32.03 
 
 
644 aa  147  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.434854  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.17 
 
 
634 aa  147  6e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1919  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.41 
 
 
631 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3398  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.96 
 
 
594 aa  147  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108074  normal  0.978255 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1756  asparagine synthase family amidotransferase  32.99 
 
 
594 aa  146  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.9 
 
 
678 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0346  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.96 
 
 
610 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3771  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.35 
 
 
598 aa  145  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.452374  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0524  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.45 
 
 
595 aa  145  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4039  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.62 
 
 
633 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354675  normal  0.528504 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0058  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  28.1 
 
 
629 aa  144  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1483  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  27.63 
 
 
616 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0138  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.04 
 
 
631 aa  143  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0809158  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3421  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.46 
 
 
662 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0816  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.82 
 
 
590 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816546  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.22 
 
 
629 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411872  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0142  asparagine synthase family amidotransferase  30.1 
 
 
590 aa  142  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0588532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1310  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.76 
 
 
615 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000179862  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2724  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.48 
 
 
621 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5441  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.29 
 
 
656 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277238  normal  0.0334078 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.82 
 
 
619 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5099  asparagine synthase family amidotransferase  29.66 
 
 
594 aa  141  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1074  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.76 
 
 
592 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1157  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.76 
 
 
592 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1055  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.76 
 
 
592 aa  140  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1053  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.76 
 
 
592 aa  140  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0060  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.78 
 
 
588 aa  140  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.58042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.07 
 
 
660 aa  140  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3751  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.36 
 
 
655 aa  140  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1056  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.16 
 
 
615 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00820403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4134  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.76 
 
 
615 aa  140  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0371277  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1234  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.37 
 
 
615 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2327  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.81 
 
 
629 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.752356  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3533  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  24.18 
 
 
621 aa  140  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0858  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.15 
 
 
655 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6500  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.72 
 
 
638 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3607  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  23.88 
 
 
615 aa  139  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3531  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.93 
 
 
596 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0213452  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.6 
 
 
666 aa  138  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1505  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.57 
 
 
615 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10450  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.71 
 
 
938 aa  138  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00957139  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4334  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.68 
 
 
645 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969348  decreased coverage  0.00494377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>