127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3241 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3241  asparagine synthase  100 
 
 
649 aa  1319    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3028  asparagine synthase  30.14 
 
 
592 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0855  asparagine synthase  30.24 
 
 
644 aa  196  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.434854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2340  asparagine synthase  24.22 
 
 
649 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.139025 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3272  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.71 
 
 
654 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1279  asparagine synthase  27.05 
 
 
642 aa  160  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0819  asparagine synthase  27.46 
 
 
653 aa  151  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1346  asparagine synthase  28.36 
 
 
639 aa  147  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1351  asparagine synthase  27.39 
 
 
640 aa  147  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3386  asparagine synthase  22.84 
 
 
645 aa  132  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.320391  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1460  asparagine synthase  26.89 
 
 
634 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2657  asparagine synthase  21.24 
 
 
639 aa  95.1  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0825967  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0967  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.41 
 
 
676 aa  92.8  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1153  asparagine synthase  27.25 
 
 
659 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4548  asparagine synthase  25.7 
 
 
751 aa  76.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84734  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1216  asparagine synthase  24.86 
 
 
626 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.108525  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2557  putative asparagine synthetase  25.68 
 
 
626 aa  68.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0186  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  21.3 
 
 
583 aa  68.6  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4904  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25 
 
 
613 aa  68.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0220651  normal  0.122286 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0125  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.23 
 
 
571 aa  65.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2952  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.39 
 
 
609 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.101456  normal  0.924945 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2829  asparagine synthase  25.71 
 
 
654 aa  64.7  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2826  asparagine synthase  26.92 
 
 
662 aa  64.7  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5966  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.56 
 
 
893 aa  63.9  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111384  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2216  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  21.86 
 
 
596 aa  62.4  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0050  asparagine synthase  24.42 
 
 
636 aa  62.4  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.31 
 
 
666 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1462  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.36 
 
 
630 aa  61.6  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.352758  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4334  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.89 
 
 
645 aa  61.6  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969348  decreased coverage  0.00494377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0474  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.11 
 
 
633 aa  61.2  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0346  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.8 
 
 
610 aa  60.5  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4478  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.11 
 
 
666 aa  59.3  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.48246  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5318  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.73 
 
 
657 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0355  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.99 
 
 
636 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2388  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.88 
 
 
627 aa  58.5  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.34 
 
 
664 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2533  asparagine synthase  23.96 
 
 
570 aa  58.2  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  20.67 
 
 
634 aa  57.8  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3554  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.84 
 
 
640 aa  57.4  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3607  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  22.31 
 
 
615 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3533  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.91 
 
 
621 aa  56.2  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1483  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  27.88 
 
 
616 aa  55.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2937  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.85 
 
 
586 aa  55.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37560  asparagine synthetase, glutamine-hydrolysing  25.2 
 
 
610 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.761947  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0858  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.46 
 
 
655 aa  53.9  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0668  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.32 
 
 
651 aa  53.9  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.223123  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1965  asparagine synthase  23.24 
 
 
624 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595077  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1921  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.41 
 
 
622 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1682  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.41 
 
 
622 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2064  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.38 
 
 
582 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153066  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.57 
 
 
592 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0936  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.41 
 
 
622 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1222  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.41 
 
 
622 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.848255  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0321  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.41 
 
 
622 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0231  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.41 
 
 
622 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.166027  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2198  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.41 
 
 
622 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.609185  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1501  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.4 
 
 
614 aa  52.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1259  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25.33 
 
 
615 aa  52  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2466  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.48 
 
 
625 aa  52  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.1 
 
 
629 aa  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1234  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25.45 
 
 
615 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  24.76 
 
 
632 aa  52  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1310  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25.45 
 
 
615 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000179862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1055  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25.45 
 
 
592 aa  51.2  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1053  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25.45 
 
 
592 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0959  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.88 
 
 
635 aa  51.6  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3071  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.98 
 
 
612 aa  51.2  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0872  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.68 
 
 
618 aa  51.6  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0025755  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.39 
 
 
619 aa  51.6  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0472  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  26.25 
 
 
624 aa  51.2  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5254  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.15 
 
 
597 aa  51.2  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.381893  normal  0.232411 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1074  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25 
 
 
592 aa  50.8  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1157  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25 
 
 
592 aa  50.8  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0232  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.41 
 
 
622 aa  50.8  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1207  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25.35 
 
 
615 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0454357  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0058  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  21.43 
 
 
629 aa  50.8  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4134  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  24.89 
 
 
615 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0371277  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0101  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.12 
 
 
615 aa  50.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4217  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.85 
 
 
655 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1852  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.21 
 
 
618 aa  49.3  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.358724  normal  0.618744 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3523  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.34 
 
 
656 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.848758  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4843  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.34 
 
 
656 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0921814  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0896  asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]  21.97 
 
 
632 aa  49.3  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3751  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.9 
 
 
655 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1119  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing  21.97 
 
 
632 aa  49.7  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4740  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.85 
 
 
655 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.96 
 
 
629 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2172  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.53 
 
 
665 aa  48.9  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.71793  hitchhiker  0.0000206838 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1505  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.4 
 
 
615 aa  48.9  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.46 
 
 
678 aa  48.9  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1056  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.11 
 
 
615 aa  48.9  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00820403  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5441  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.16 
 
 
656 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277238  normal  0.0334078 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1389  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.32 
 
 
625 aa  48.5  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0838  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  21.2 
 
 
633 aa  48.5  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4419  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.34 
 
 
665 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1366  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.67 
 
 
642 aa  48.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1975  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.29 
 
 
643 aa  47.8  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1034  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.65 
 
 
614 aa  47.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  19.6 
 
 
628 aa  48.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4250  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.11 
 
 
619 aa  47.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.210666 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>