44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0308 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1915  asparagine synthase  99.29 
 
 
533 aa  827    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1902  asparagine synthase  98.58 
 
 
531 aa  815    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0308  asparagine synthase  100 
 
 
422 aa  836    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611476  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1646  hypothetical protein  100 
 
 
422 aa  836    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238997  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1202  hypothetical protein  99.76 
 
 
469 aa  832    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0441787  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2439  asparagine synthase  83.96 
 
 
582 aa  707    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0380911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2066  asparagine synthase  99.29 
 
 
580 aa  825    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0480532  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0901  hypothetical protein  23.15 
 
 
603 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.34209 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11980  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.79 
 
 
649 aa  63.2  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.658522  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0742  asparagine synthase family amidotransferase  28.57 
 
 
592 aa  52.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2461  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.17 
 
 
593 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828988  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0114  asparagine synthase family amidotransferase  27.11 
 
 
592 aa  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1986  asparagine synthase  29.86 
 
 
583 aa  50.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1053  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.04 
 
 
649 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000122454  hitchhiker  0.00273706 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1682  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.7 
 
 
622 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1921  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.7 
 
 
622 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2198  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.7 
 
 
622 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.609185  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0231  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.7 
 
 
622 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.166027  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0936  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.7 
 
 
622 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1222  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.7 
 
 
622 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.848255  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0321  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.7 
 
 
622 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2533  asparagine synthase  27.05 
 
 
570 aa  46.6  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1153  asparagine synthase  37.5 
 
 
659 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0232  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.7 
 
 
622 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.3 
 
 
591 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2955  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.34 
 
 
589 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0385583 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1953  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.99 
 
 
611 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3766  asparagine synthase family amidotransferase  25.1 
 
 
599 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2241  asparagine synthase  27.93 
 
 
568 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67145  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0265  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.57 
 
 
581 aa  44.3  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2680  asparagine synthase amidotransferase  27.04 
 
 
590 aa  43.9  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0122276  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0472  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.03 
 
 
624 aa  43.9  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2280  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.57 
 
 
605 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000628708  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.95 
 
 
634 aa  43.5  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.57 
 
 
633 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3705  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.5 
 
 
647 aa  43.5  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.57 
 
 
633 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.57 
 
 
633 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.57 
 
 
633 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  28.57 
 
 
633 aa  43.1  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.57 
 
 
633 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  28.57 
 
 
633 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.57 
 
 
633 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1652  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.78 
 
 
633 aa  43.1  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000197095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>