46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2066 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I2439  asparagine synthase  84.88 
 
 		 582 aa  988    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0380911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0308  asparagine synthase  99.29 
 
 		 422 aa  825    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611476  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1646  hypothetical protein  99.29 
 
 		 422 aa  825    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238997  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1902  asparagine synthase  99.06 
 
 		 531 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1915  asparagine synthase  99.62 
 
 		 533 aa  1057    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2066  asparagine synthase  100 
 
 		 580 aa  1155    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0480532  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1202  hypothetical protein  99.57 
 
 		 469 aa  921    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0441787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0849  asparagine synthase  99.01 
 
 		 101 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1649  asparagine synthase  99.01 
 
 		 101 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.968638  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0311  hypothetical protein  99.01 
 
 		 101 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0901  hypothetical protein  23.87 
 
 		 603 aa  125  3e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.34209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1986  asparagine synthase  26.67 
 
 		 583 aa  66.6  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2241  asparagine synthase  24.59 
 
 		 568 aa  63.9  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11980  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.79 
 
 		 649 aa  62.8  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.658522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2533  asparagine synthase  25.21 
 
 		 570 aa  61.2  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0742  asparagine synthase family amidotransferase  27.71 
 
 		 592 aa  55.1  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2461  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.17 
 
 		 593 aa  53.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828988  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0472  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25.99 
 
 		 624 aa  53.5  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4243  asparagine synthase  24.24 
 
 		 630 aa  51.6  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0114  asparagine synthase family amidotransferase  27.47 
 
 		 592 aa  50.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2051  asparagine synthase  24.75 
 
 		 613 aa  49.3  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5191  asparagine synthase  25 
 
 		 579 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.80245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1053  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.04 
 
 		 649 aa  47.4  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000122454  hitchhiker  0.00273706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.46 
 
 		 591 aa  47.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0936  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.7 
 
 		 622 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1921  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.7 
 
 		 622 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1682  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.7 
 
 		 622 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0232  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.7 
 
 		 622 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1222  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.7 
 
 		 622 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.848255  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0321  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.7 
 
 		 622 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0231  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.7 
 
 		 622 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.166027  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2198  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.7 
 
 		 622 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.609185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1953  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.99 
 
 		 611 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1153  asparagine synthase  37.5 
 
 		 659 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3766  asparagine synthase family amidotransferase  25.57 
 
 		 599 aa  46.2  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3705  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.86 
 
 		 647 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2541  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.72 
 
 		 621 aa  45.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.800468  normal  0.489677 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2955  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.06 
 
 		 589 aa  45.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0385583 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0265  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.12 
 
 		 581 aa  45.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2680  asparagine synthase amidotransferase  27.04 
 
 		 590 aa  44.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0122276  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1633  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  24.89 
 
 		 590 aa  44.3  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1668  asparagine synthase  26.48 
 
 		 589 aa  43.9  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19370  putative asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  27.56 
 
 		 589 aa  43.9  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.826487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3747  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  24.77 
 
 		 590 aa  43.9  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.95 
 
 		 634 aa  43.5  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2728  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.72 
 
 		 593 aa  43.5  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.206697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>