39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1902 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1902  asparagine synthase  100 
 
 
531 aa  1061    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1202  hypothetical protein  98.34 
 
 
469 aa  811    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0441787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0308  asparagine synthase  98.58 
 
 
422 aa  815    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611476  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2066  asparagine synthase  99.06 
 
 
580 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0480532  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2439  asparagine synthase  85.61 
 
 
582 aa  919    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0380911  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1915  asparagine synthase  99.44 
 
 
533 aa  1055    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1646  hypothetical protein  98.58 
 
 
422 aa  815    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0311  hypothetical protein  99.01 
 
 
101 aa  209  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0849  asparagine synthase  99.01 
 
 
101 aa  209  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1649  asparagine synthase  99.01 
 
 
101 aa  209  9e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.968638  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0901  hypothetical protein  23.83 
 
 
603 aa  123  9e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.34209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1986  asparagine synthase  26.97 
 
 
583 aa  63.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2241  asparagine synthase  24.59 
 
 
568 aa  61.6  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67145  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2533  asparagine synthase  24.79 
 
 
570 aa  61.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11980  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.79 
 
 
649 aa  60.8  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.658522  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0742  asparagine synthase family amidotransferase  27.27 
 
 
592 aa  53.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2461  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.88 
 
 
593 aa  51.2  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828988  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0472  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25.66 
 
 
624 aa  50.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4243  asparagine synthase  24.24 
 
 
630 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0114  asparagine synthase family amidotransferase  26.84 
 
 
592 aa  48.5  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2051  asparagine synthase  24.75 
 
 
613 aa  47.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380231  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5191  asparagine synthase  24.81 
 
 
579 aa  47  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.80245  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1222  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.7 
 
 
622 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.848255  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1153  asparagine synthase  35 
 
 
659 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1053  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.04 
 
 
649 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000122454  hitchhiker  0.00273706 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2127  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25.2 
 
 
605 aa  45.8  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1921  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.7 
 
 
622 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1682  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.7 
 
 
622 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0936  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.7 
 
 
622 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2198  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.7 
 
 
622 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.609185  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0231  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.7 
 
 
622 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.166027  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0321  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  41.86 
 
 
622 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0232  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.7 
 
 
622 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.8 
 
 
591 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1953  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.99 
 
 
611 aa  45.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0265  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.74 
 
 
581 aa  44.3  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549535  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3766  asparagine synthase family amidotransferase  24.71 
 
 
599 aa  44.3  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3705  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.5 
 
 
647 aa  43.9  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2541  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.07 
 
 
621 aa  43.5  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.800468  normal  0.489677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>