54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1689 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1689  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  270  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.729509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1620  hypothetical protein  98.51 
 
 		 134 aa  266  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1695  hypothetical protein  97.76 
 
 		 134 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362042  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1913  hypothetical protein  84.09 
 
 		 132 aa  233  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1729  hypothetical protein  81.34 
 
 		 134 aa  225  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1541  hypothetical protein  77.69 
 
 		 133 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2960  hypothetical protein  77.69 
 
 		 133 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.946654  normal  0.485074 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2817  hypothetical protein  77.69 
 
 		 133 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.323587  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2835  hypothetical protein  77.69 
 
 		 133 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.849691  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2790  hypothetical protein  78.99 
 
 		 132 aa  197  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0273206  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2555  hypothetical protein  72.52 
 
 		 130 aa  194  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3209  hypothetical protein  73.23 
 
 		 131 aa  188  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000120435  unclonable  0.0000000114703 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1467  hypothetical protein  72.27 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000434659  decreased coverage  0.0000172083 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1369  hypothetical protein  62.02 
 
 		 135 aa  174  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.741634  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1671  hypothetical protein  66.96 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000194021  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2721  hypothetical protein  61.29 
 
 		 133 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1675  hypothetical protein  28 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2666  hypothetical protein  28.8 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000306187  normal  0.191163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2773  hypothetical protein  28.8 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.474482  hitchhiker  0.00136931 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1394  hypothetical protein  29.03 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.031757  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2599  hypothetical protein  27.64 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000664036  hitchhiker  0.00000856257 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1471  hypothetical protein  29.46 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0482642  hitchhiker  0.000540477 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1969  putative lipoprotein  32.71 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612911  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2785  hypothetical protein  31.18 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3082  lipoprotein-related protein  34.83 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3279  hypothetical protein  29.89 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.627727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3205  hypothetical protein  29.52 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1487  hypothetical protein  24 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0816292  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1523  hypothetical protein  24 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0159792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1492  hypothetical protein  24 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000310821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2859  hypothetical protein  24 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00929385  hitchhiker  0.00000000043608 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01451  hypothetical protein  28.67 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0121  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2552  hypothetical protein  26.72 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3700  hypothetical protein  29.82 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1194  hypothetical protein  24.76 
 
 		 228 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  25.2 
 
 		 305 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004013  lipoprotein-related protein  26.57 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0582  putative lipoprotein  25.93 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000375847  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4099  lipoprotein  25.47 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0921  glycoprotein/polysaccharide metabolism  27.34 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.226366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3054  lipoprotein  25.33 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0385716  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1465  putative lipoprotein  25.23 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16840  putative lipoprotein  25.23 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1125  lipoprotein  25.47 
 
 		 132 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1373  hypothetical protein  24.14 
 
 		 136 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0504546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4204  hypothetical protein  25.47 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1519  putative lipoprotein  25.47 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345658  normal  0.713007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0515  putative lipoprotein  26.43 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0568  hypothetical protein  26.43 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0525  putative lipoprotein  26.43 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0465904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0506  putative lipoprotein  26.43 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000703673  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0509  putative lipoprotein  26.43 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.668519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  29.41 
 
 		 246 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>