63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1695 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1695  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  270  7e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1620  hypothetical protein  99.25 
 
 		 134 aa  268  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1689  hypothetical protein  97.76 
 
 		 134 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.729509  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1913  hypothetical protein  84.85 
 
 		 132 aa  233  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1729  hypothetical protein  79.85 
 
 		 134 aa  221  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2817  hypothetical protein  76.15 
 
 		 133 aa  209  9e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.323587  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2835  hypothetical protein  76.15 
 
 		 133 aa  209  9e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.849691  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1541  hypothetical protein  76.15 
 
 		 133 aa  209  9e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2960  hypothetical protein  76.15 
 
 		 133 aa  209  9e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.946654  normal  0.485074 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2790  hypothetical protein  78.15 
 
 		 132 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0273206  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2555  hypothetical protein  71.76 
 
 		 130 aa  191  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3209  hypothetical protein  71.32 
 
 		 131 aa  185  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000120435  unclonable  0.0000000114703 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1467  hypothetical protein  72.27 
 
 		 129 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000434659  decreased coverage  0.0000172083 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1369  hypothetical protein  62.02 
 
 		 135 aa  176  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.741634  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1671  hypothetical protein  67.86 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000194021  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2721  hypothetical protein  59.4 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1394  hypothetical protein  29.51 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.031757  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2666  hypothetical protein  28.46 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000306187  normal  0.191163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1675  hypothetical protein  27.64 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2773  hypothetical protein  28.46 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.474482  hitchhiker  0.00136931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2599  hypothetical protein  28 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000664036  hitchhiker  0.00000856257 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1969  putative lipoprotein  32.71 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612911  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3279  hypothetical protein  31.03 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.627727 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3082  lipoprotein-related protein  34.31 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01451  hypothetical protein  29.37 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1471  hypothetical protein  28.57 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0482642  hitchhiker  0.000540477 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3700  hypothetical protein  31.58 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2785  hypothetical protein  31.18 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2552  hypothetical protein  27.59 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0121  hypothetical protein  31.25 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1523  hypothetical protein  24 
 
 		 139 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0159792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1492  hypothetical protein  24 
 
 		 139 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000310821  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1487  hypothetical protein  24 
 
 		 139 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0816292  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2859  hypothetical protein  24 
 
 		 139 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00929385  hitchhiker  0.00000000043608 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004013  lipoprotein-related protein  27.27 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1194  hypothetical protein  25.71 
 
 		 228 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3205  hypothetical protein  30.11 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  25.98 
 
 		 305 aa  47.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3054  lipoprotein  26 
 
 		 185 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0385716  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0921  glycoprotein/polysaccharide metabolism  28.06 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.226366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4099  lipoprotein  24.75 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0506  putative lipoprotein  27.14 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000703673  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0568  hypothetical protein  27.14 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0515  putative lipoprotein  27.14 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0509  putative lipoprotein  27.14 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.668519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0525  putative lipoprotein  27.14 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0465904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1465  putative lipoprotein  25.69 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16840  putative lipoprotein  25.69 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0582  putative lipoprotein  25.93 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000375847  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1125  lipoprotein  25.47 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  30.59 
 
 		 246 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0543  putative lipoprotein  31.87 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50203  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1519  putative lipoprotein  23.48 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345658  normal  0.713007 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00409  hypothetical protein  31.87 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0497  putative lipoprotein  31.87 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3162  glycoprotein/polysaccharide metabolism  31.87 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0489  putative lipoprotein  31.87 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0530  putative lipoprotein  31.87 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4204  hypothetical protein  23.48 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00405  predicted outer membrane lipoprotein  31.87 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2630  hypothetical protein  32.43 
 
 		 297 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0738  hypothetical protein  26.32 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.98341  normal  0.262809 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0743  hypothetical protein  27.47 
 
 		 288 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>