54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1671 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1671  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  291  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000194021  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2721  hypothetical protein  66.94 
 
 		 133 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1695  hypothetical protein  62.02 
 
 		 134 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1620  hypothetical protein  62.02 
 
 		 134 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2960  hypothetical protein  61.72 
 
 		 133 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.946654  normal  0.485074 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2835  hypothetical protein  61.72 
 
 		 133 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.849691  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2817  hypothetical protein  61.72 
 
 		 133 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.323587  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1541  hypothetical protein  61.72 
 
 		 133 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1729  hypothetical protein  60.94 
 
 		 134 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2555  hypothetical protein  62.31 
 
 		 130 aa  170  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1913  hypothetical protein  60.16 
 
 		 132 aa  169  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1689  hypothetical protein  61.24 
 
 		 134 aa  169  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.729509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3209  hypothetical protein  61.24 
 
 		 131 aa  163  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000120435  unclonable  0.0000000114703 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2790  hypothetical protein  61.02 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0273206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1369  hypothetical protein  61.06 
 
 		 135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.741634  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1467  hypothetical protein  55.93 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000434659  decreased coverage  0.0000172083 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1394  hypothetical protein  29.91 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.031757  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2552  hypothetical protein  28.23 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1969  putative lipoprotein  30.07 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612911  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2785  hypothetical protein  28.8 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3205  hypothetical protein  28.3 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2666  hypothetical protein  26.92 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000306187  normal  0.191163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2773  hypothetical protein  26.92 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.474482  hitchhiker  0.00136931 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1675  hypothetical protein  26.5 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2599  hypothetical protein  26.09 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000664036  hitchhiker  0.00000856257 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3082  lipoprotein-related protein  32.04 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1492  hypothetical protein  25.93 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000310821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1523  hypothetical protein  25.93 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0159792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2859  hypothetical protein  25.93 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00929385  hitchhiker  0.00000000043608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1487  hypothetical protein  25.93 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0816292  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.63 
 
 		 305 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1471  hypothetical protein  26.4 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0482642  hitchhiker  0.000540477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4099  lipoprotein  26.21 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1465  putative lipoprotein  27.18 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1083  putative lipoprotein  26.26 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3279  hypothetical protein  28.74 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.627727 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01451  hypothetical protein  25.96 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16840  putative lipoprotein  27.18 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3075  putative lipoprotein  29.85 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000475601  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0121  hypothetical protein  31.25 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3035  hypothetical protein  29.85 
 
 		 210 aa  47  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3216  putative lipoprotein  29.85 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696284  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004013  lipoprotein-related protein  26.92 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4204  hypothetical protein  26.21 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1519  putative lipoprotein  26.21 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345658  normal  0.713007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1125  lipoprotein  25.24 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719915  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  25.58 
 
 		 267 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  25.58 
 
 		 297 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3700  hypothetical protein  28.3 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4560  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.04 
 
 		 284 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1112  putative lipoprotein  26.42 
 
 		 163 aa  42  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000897823  hitchhiker  0.00000162029 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1327  hypothetical protein  27.91 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0545015 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25.2 
 
 		 267 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0743  hypothetical protein  27.55 
 
 		 288 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>