53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2555 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2555  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  263  7e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1689  hypothetical protein  72.52 
 
 		 134 aa  194  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.729509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1620  hypothetical protein  71.76 
 
 		 134 aa  192  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1729  hypothetical protein  69.23 
 
 		 134 aa  191  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1695  hypothetical protein  71.76 
 
 		 134 aa  191  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1467  hypothetical protein  73.6 
 
 		 129 aa  191  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000434659  decreased coverage  0.0000172083 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3209  hypothetical protein  72.09 
 
 		 131 aa  191  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000120435  unclonable  0.0000000114703 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1913  hypothetical protein  71.32 
 
 		 132 aa  190  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2790  hypothetical protein  70.4 
 
 		 132 aa  189  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0273206  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2817  hypothetical protein  68.46 
 
 		 133 aa  187  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.323587  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2835  hypothetical protein  68.46 
 
 		 133 aa  187  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.849691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2960  hypothetical protein  68.46 
 
 		 133 aa  187  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.946654  normal  0.485074 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1541  hypothetical protein  68.46 
 
 		 133 aa  187  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2721  hypothetical protein  62.31 
 
 		 133 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1369  hypothetical protein  64.57 
 
 		 135 aa  166  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.741634  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1671  hypothetical protein  66.07 
 
 		 142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000194021  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3205  hypothetical protein  32.98 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3082  lipoprotein-related protein  32.2 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1969  putative lipoprotein  31.71 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612911  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01451  hypothetical protein  28.37 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1675  hypothetical protein  28.72 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2666  hypothetical protein  24.03 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000306187  normal  0.191163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2773  hypothetical protein  26.42 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.474482  hitchhiker  0.00136931 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1394  hypothetical protein  25.2 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.031757  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2599  hypothetical protein  24.81 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000664036  hitchhiker  0.00000856257 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1194  hypothetical protein  27.62 
 
 		 228 aa  53.9  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0121  hypothetical protein  31.71 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2785  hypothetical protein  30.85 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1471  hypothetical protein  31 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0482642  hitchhiker  0.000540477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4099  lipoprotein  23.44 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3279  hypothetical protein  25.62 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.627727 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0582  putative lipoprotein  27.54 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000375847  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004013  lipoprotein-related protein  27.66 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1125  lipoprotein  23.44 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1492  hypothetical protein  26.17 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000310821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2859  hypothetical protein  26.17 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00929385  hitchhiker  0.00000000043608 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1523  hypothetical protein  26.17 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0159792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1487  hypothetical protein  26.17 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0816292  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4204  hypothetical protein  23.44 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1519  putative lipoprotein  23.44 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345658  normal  0.713007 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3700  hypothetical protein  30.48 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2552  hypothetical protein  26.47 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1083  putative lipoprotein  23.08 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1465  putative lipoprotein  25.42 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16840  putative lipoprotein  25.42 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2630  hypothetical protein  30.53 
 
 		 297 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  26.74 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.52 
 
 		 305 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3075  putative lipoprotein  26.92 
 
 		 173 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000475601  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3035  hypothetical protein  26.92 
 
 		 210 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3216  putative lipoprotein  26.92 
 
 		 173 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696284  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1519  hypothetical protein  23.42 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0743  hypothetical protein  25.66 
 
 		 288 aa  40.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>