41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2721 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2721  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  267  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1671  hypothetical protein  70.54 
 
 		 142 aa  176  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000194021  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1729  hypothetical protein  63.71 
 
 		 134 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1541  hypothetical protein  63.71 
 
 		 133 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2960  hypothetical protein  63.71 
 
 		 133 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.946654  normal  0.485074 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2817  hypothetical protein  63.71 
 
 		 133 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.323587  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2835  hypothetical protein  63.71 
 
 		 133 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.849691  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2555  hypothetical protein  62.31 
 
 		 130 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3209  hypothetical protein  64.75 
 
 		 131 aa  168  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000120435  unclonable  0.0000000114703 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1467  hypothetical protein  63.93 
 
 		 129 aa  167  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000434659  decreased coverage  0.0000172083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1913  hypothetical protein  60.98 
 
 		 132 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1689  hypothetical protein  61.29 
 
 		 134 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.729509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2790  hypothetical protein  61.48 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0273206  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1620  hypothetical protein  60.48 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1695  hypothetical protein  59.4 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1369  hypothetical protein  58.41 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.741634  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1675  hypothetical protein  27.42 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2666  hypothetical protein  26.36 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000306187  normal  0.191163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2773  hypothetical protein  26.36 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.474482  hitchhiker  0.00136931 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3082  lipoprotein-related protein  32.81 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2599  hypothetical protein  26.36 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000664036  hitchhiker  0.00000856257 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2552  hypothetical protein  26.98 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1969  putative lipoprotein  28.99 
 
 		 162 aa  51.2  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612911  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2859  hypothetical protein  25 
 
 		 139 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00929385  hitchhiker  0.00000000043608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1492  hypothetical protein  25 
 
 		 139 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000310821  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3205  hypothetical protein  27.82 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1523  hypothetical protein  25 
 
 		 139 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0159792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2785  hypothetical protein  26.89 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1487  hypothetical protein  25 
 
 		 139 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0816292  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1471  hypothetical protein  27.59 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0482642  hitchhiker  0.000540477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1394  hypothetical protein  25.37 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.031757  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0582  putative lipoprotein  28.15 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000375847  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4204  hypothetical protein  25.42 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1083  putative lipoprotein  25.96 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1125  lipoprotein  25.42 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1519  putative lipoprotein  25.42 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345658  normal  0.713007 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4099  lipoprotein  24.39 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1465  putative lipoprotein  27.93 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16840  putative lipoprotein  27.93 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3279  hypothetical protein  25.29 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.627727 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1194  hypothetical protein  26.04 
 
 		 228 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>