68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1369 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1369  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  273  5e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.741634  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1620  hypothetical protein  62.79 
 
 
134 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3209  hypothetical protein  70.8 
 
 
131 aa  177  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000120435  unclonable  0.0000000114703 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1467  hypothetical protein  66.13 
 
 
129 aa  176  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000434659  decreased coverage  0.0000172083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1695  hypothetical protein  62.02 
 
 
134 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362042  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2790  hypothetical protein  67.5 
 
 
132 aa  176  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0273206  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1913  hypothetical protein  64.8 
 
 
132 aa  174  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1689  hypothetical protein  62.02 
 
 
134 aa  174  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.729509  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2555  hypothetical protein  64.57 
 
 
130 aa  166  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2835  hypothetical protein  63.16 
 
 
133 aa  166  8e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.849691  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2817  hypothetical protein  63.16 
 
 
133 aa  166  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.323587  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1541  hypothetical protein  63.16 
 
 
133 aa  166  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686411  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2960  hypothetical protein  63.16 
 
 
133 aa  166  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.946654  normal  0.485074 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1729  hypothetical protein  64.46 
 
 
134 aa  166  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1671  hypothetical protein  61.26 
 
 
142 aa  149  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000194021  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2721  hypothetical protein  58.41 
 
 
133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2666  hypothetical protein  24.64 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000306187  normal  0.191163 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1969  putative lipoprotein  30.77 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612911  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2773  hypothetical protein  24.64 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.474482  hitchhiker  0.00136931 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1471  hypothetical protein  27.13 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0482642  hitchhiker  0.000540477 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2599  hypothetical protein  25 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000664036  hitchhiker  0.00000856257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1394  hypothetical protein  23.7 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.031757  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3279  hypothetical protein  26.32 
 
 
142 aa  55.1  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.627727 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2552  hypothetical protein  25.21 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1487  hypothetical protein  23.62 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0816292  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1492  hypothetical protein  23.62 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000310821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2859  hypothetical protein  23.62 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00929385  hitchhiker  0.00000000043608 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1523  hypothetical protein  23.62 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0159792  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1675  hypothetical protein  22.66 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2785  hypothetical protein  26.98 
 
 
133 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1194  hypothetical protein  25.95 
 
 
228 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01451  hypothetical protein  27.94 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3205  hypothetical protein  26.09 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004013  lipoprotein-related protein  27.94 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1519  putative lipoprotein  27 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345658  normal  0.713007 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0121  hypothetical protein  30 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4204  hypothetical protein  27 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0582  putative lipoprotein  28.57 
 
 
143 aa  47.8  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000375847  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0506  putative lipoprotein  26.96 
 
 
189 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000703673  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3082  lipoprotein-related protein  29.41 
 
 
141 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0509  putative lipoprotein  26.96 
 
 
189 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.668519  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0515  putative lipoprotein  26.96 
 
 
189 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0568  hypothetical protein  26.96 
 
 
189 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0525  putative lipoprotein  26.96 
 
 
189 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0465904  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4099  lipoprotein  25 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1125  lipoprotein  25 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719915  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1112  putative lipoprotein  28.85 
 
 
163 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000897823  hitchhiker  0.00000162029 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  26.89 
 
 
246 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1083  putative lipoprotein  24.04 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3035  hypothetical protein  30.48 
 
 
210 aa  43.5  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3075  putative lipoprotein  30.48 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000475601  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3162  glycoprotein/polysaccharide metabolism  26.42 
 
 
190 aa  42  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3216  putative lipoprotein  30.48 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696284  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0530  putative lipoprotein  26.42 
 
 
190 aa  42  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0497  putative lipoprotein  26.42 
 
 
190 aa  42  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0921  glycoprotein/polysaccharide metabolism  25.22 
 
 
189 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.226366  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3054  lipoprotein  26.73 
 
 
185 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0385716  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00409  hypothetical protein  26.42 
 
 
190 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0543  putative lipoprotein  26.42 
 
 
185 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50203  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  24.44 
 
 
267 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00405  predicted outer membrane lipoprotein  26.42 
 
 
190 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0489  putative lipoprotein  26.42 
 
 
190 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1063  lipoprotein  27.62 
 
 
193 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1465  putative lipoprotein  23.4 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3156  conserved hypothetical protein  27.1 
 
 
190 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3248  lipoprotein  26.27 
 
 
194 aa  40.4  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16840  putative lipoprotein  23.4 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2630  hypothetical protein  25.98 
 
 
297 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.427988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>