58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1519 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1519  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  239  7e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1327  hypothetical protein  79.31 
 
 		 116 aa  189  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0545015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16840  putative lipoprotein  45.63 
 
 		 132 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1465  putative lipoprotein  45.63 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1083  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 132 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4099  lipoprotein  43.52 
 
 		 132 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1519  putative lipoprotein  46.73 
 
 		 132 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345658  normal  0.713007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4204  hypothetical protein  46.73 
 
 		 132 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1125  lipoprotein  46.15 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01451  hypothetical protein  40.95 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.7 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004013  lipoprotein-related protein  42.45 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0121  hypothetical protein  41.57 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1471  hypothetical protein  39.62 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0482642  hitchhiker  0.000540477 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0582  putative lipoprotein  39.78 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000375847  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3205  hypothetical protein  37.63 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2552  hypothetical protein  34.38 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3700  hypothetical protein  41.11 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2785  hypothetical protein  34.69 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3082  lipoprotein-related protein  35.14 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  36.45 
 
 		 297 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  36.45 
 
 		 267 aa  57  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1373  hypothetical protein  35 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0504546 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1487  hypothetical protein  34.38 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0816292  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2859  hypothetical protein  34.38 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00929385  hitchhiker  0.00000000043608 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1523  hypothetical protein  34.38 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0159792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2666  hypothetical protein  32.29 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000306187  normal  0.191163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1492  hypothetical protein  34.38 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000310821  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2773  hypothetical protein  32.29 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.474482  hitchhiker  0.00136931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2599  hypothetical protein  32.29 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000664036  hitchhiker  0.00000856257 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1675  hypothetical protein  32.29 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3156  conserved hypothetical protein  34.58 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858149  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1394  hypothetical protein  35.42 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.031757  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0509  putative lipoprotein  32.71 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.668519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0506  putative lipoprotein  32.71 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000703673  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0525  putative lipoprotein  32.71 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0465904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0568  hypothetical protein  32.71 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0515  putative lipoprotein  32.71 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0530  putative lipoprotein  34.58 
 
 		 190 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00405  predicted outer membrane lipoprotein  34.58 
 
 		 190 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00409  hypothetical protein  34.58 
 
 		 190 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0497  putative lipoprotein  34.58 
 
 		 190 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3162  glycoprotein/polysaccharide metabolism  34.58 
 
 		 190 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0489  putative lipoprotein  34.58 
 
 		 190 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0543  putative lipoprotein  34.58 
 
 		 185 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0921  glycoprotein/polysaccharide metabolism  32.71 
 
 		 189 aa  50.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.226366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1194  hypothetical protein  31.96 
 
 		 228 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1112  putative lipoprotein  37.38 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000897823  hitchhiker  0.00000162029 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3248  lipoprotein  35.92 
 
 		 194 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1969  putative lipoprotein  34.38 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1063  lipoprotein  36.73 
 
 		 193 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3216  putative lipoprotein  35.92 
 
 		 173 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696284  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3075  putative lipoprotein  35.92 
 
 		 173 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000475601  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2630  hypothetical protein  36.67 
 
 		 297 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3035  hypothetical protein  35.92 
 
 		 210 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  32.08 
 
 		 246 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2555  hypothetical protein  23.42 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4709  putative lipoprotein  35.56 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100593  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>