28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3828 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3828  transposon Tn7 transposition protein TnsA  100 
 
 		 275 aa  573  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4360  transposon Tn7 transposition protein TnsA  47.64 
 
 		 273 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3947  transposon Tn7 transposition protein TnsA  42.91 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3199  Tn5468, transposase protein A  40.54 
 
 		 278 aa  192  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2803  TnsA endonuclease  40.15 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1201  Tn5468, transposase protein A  37.8 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3486  Tn7-like transposition protein A  35.55 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696924  normal  0.106668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3947  TnsA endonuclease  33.21 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3996  TnsA endonuclease  32.85 
 
 		 276 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2327  TnsA endonuclease  37.89 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000207972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0182  Tn7-like transposition protein A  35.83 
 
 		 277 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3949  TnsA endonuclease  36.29 
 
 		 276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1117  Tn7-like transposition protein A  34.87 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0174  Tn7-like transposition protein A  36 
 
 		 279 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0222  TnsA endonuclease  36.29 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.262078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1876  Tn7-like transposition protein A  32.32 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2932  transposase  32.53 
 
 		 271 aa  128  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5725  hypothetical protein  41.95 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7027  TnsA endonuclease  37.63 
 
 		 282 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0245  TnsA endonuclease  33.62 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.534286 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2205  transposase  52.48 
 
 		 107 aa  112  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5195  TnsA endonuclease  38.55 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5459  transposase Tn7-like proteinA  31.12 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4327  Tn7-like transposition protein A  33.15 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4969  transposon Tn7 transposition protein TnsA  30.04 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.230743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6943  hypothetical protein  28.35 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.504828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1174  hypothetical protein  28.22 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3109  transposon Tn7 transposition protein A  29.3 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.201874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>