28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3949 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3949  TnsA endonuclease  100 
 
 
276 aa  570  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0222  TnsA endonuclease  49.11 
 
 
281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.262078  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0182  Tn7-like transposition protein A  43.85 
 
 
277 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3199  Tn5468, transposase protein A  42.8 
 
 
278 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2803  TnsA endonuclease  42.42 
 
 
288 aa  209  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3486  Tn7-like transposition protein A  41.9 
 
 
272 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696924  normal  0.106668 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1201  Tn5468, transposase protein A  48.58 
 
 
276 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3996  TnsA endonuclease  41.11 
 
 
276 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3947  TnsA endonuclease  40.71 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2327  TnsA endonuclease  39.92 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000207972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0174  Tn7-like transposition protein A  44.71 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1117  Tn7-like transposition protein A  36.19 
 
 
281 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1876  Tn7-like transposition protein A  37.36 
 
 
284 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7027  TnsA endonuclease  43.07 
 
 
282 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0245  TnsA endonuclease  38.33 
 
 
276 aa  152  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.534286 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3828  transposon Tn7 transposition protein TnsA  36.29 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5725  hypothetical protein  35.74 
 
 
295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4327  Tn7-like transposition protein A  40.11 
 
 
275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5195  TnsA endonuclease  38.46 
 
 
299 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3947  transposon Tn7 transposition protein TnsA  33.59 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4360  transposon Tn7 transposition protein TnsA  35.74 
 
 
273 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2932  transposase  30.67 
 
 
271 aa  133  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2205  transposase  50 
 
 
107 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5459  transposase Tn7-like proteinA  28.98 
 
 
317 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6943  hypothetical protein  26.51 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.504828  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4969  transposon Tn7 transposition protein TnsA  26.81 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.230743  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3109  transposon Tn7 transposition protein A  28.32 
 
 
266 aa  64.7  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.201874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1174  hypothetical protein  28.12 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>