28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0222 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0222  TnsA endonuclease  100 
 
 		 281 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.262078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3949  TnsA endonuclease  49.11 
 
 		 276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0182  Tn7-like transposition protein A  44.4 
 
 		 277 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1201  Tn5468, transposase protein A  47.6 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3486  Tn7-like transposition protein A  39.22 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696924  normal  0.106668 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2803  TnsA endonuclease  46.22 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3199  Tn5468, transposase protein A  46.22 
 
 		 278 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3996  TnsA endonuclease  35.6 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2327  TnsA endonuclease  34.9 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000207972 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3947  TnsA endonuclease  35.2 
 
 		 276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0174  Tn7-like transposition protein A  38.91 
 
 		 279 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5725  hypothetical protein  40.68 
 
 		 295 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1876  Tn7-like transposition protein A  36.23 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0245  TnsA endonuclease  38.24 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.534286 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1117  Tn7-like transposition protein A  31.54 
 
 		 281 aa  149  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7027  TnsA endonuclease  38.4 
 
 		 282 aa  148  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3947  transposon Tn7 transposition protein TnsA  37.1 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3828  transposon Tn7 transposition protein TnsA  36.29 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4360  transposon Tn7 transposition protein TnsA  37.14 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2932  transposase  35.66 
 
 		 271 aa  132  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5195  TnsA endonuclease  40.68 
 
 		 299 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4327  Tn7-like transposition protein A  40.94 
 
 		 275 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2205  transposase  46.23 
 
 		 107 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5459  transposase Tn7-like proteinA  30.77 
 
 		 317 aa  89  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6943  hypothetical protein  27.06 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.504828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3109  transposon Tn7 transposition protein A  32.75 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.201874 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4969  transposon Tn7 transposition protein TnsA  32.16 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.230743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1174  hypothetical protein  26.28 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>