28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5195 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_5195  TnsA endonuclease  100 
 
 		 299 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5725  hypothetical protein  38.64 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7027  TnsA endonuclease  35.4 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3949  TnsA endonuclease  38.46 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3996  TnsA endonuclease  37.62 
 
 		 276 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3947  TnsA endonuclease  39.66 
 
 		 276 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2803  TnsA endonuclease  39.68 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3199  Tn5468, transposase protein A  39.68 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2327  TnsA endonuclease  35.78 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000207972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0182  Tn7-like transposition protein A  40.88 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0222  TnsA endonuclease  40.68 
 
 		 281 aa  126  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.262078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1201  Tn5468, transposase protein A  37.84 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3947  transposon Tn7 transposition protein TnsA  35.14 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0174  Tn7-like transposition protein A  41.52 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1876  Tn7-like transposition protein A  34.44 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3486  Tn7-like transposition protein A  32.96 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696924  normal  0.106668 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0245  TnsA endonuclease  36.9 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.534286 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3828  transposon Tn7 transposition protein TnsA  38.55 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1117  Tn7-like transposition protein A  32.62 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4327  Tn7-like transposition protein A  35.68 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5459  transposase Tn7-like proteinA  32.85 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2932  transposase  34.98 
 
 		 271 aa  96.3  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4360  transposon Tn7 transposition protein TnsA  36.36 
 
 		 273 aa  95.5  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2205  transposase  46.32 
 
 		 107 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6943  hypothetical protein  25.69 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.504828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3109  transposon Tn7 transposition protein A  29.24 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.201874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1174  hypothetical protein  26.98 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4969  transposon Tn7 transposition protein TnsA  25.14 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.230743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>