23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1174 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1174  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  635    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7027  TnsA endonuclease  27.21 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5725  hypothetical protein  24.91 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3486  Tn7-like transposition protein A  27.19 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696924  normal  0.106668 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1117  Tn7-like transposition protein A  23.19 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3199  Tn5468, transposase protein A  29.59 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0174  Tn7-like transposition protein A  25.86 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2803  TnsA endonuclease  29.59 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1201  Tn5468, transposase protein A  28.79 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2327  TnsA endonuclease  27.78 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000207972 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4360  transposon Tn7 transposition protein TnsA  27.98 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3947  transposon Tn7 transposition protein TnsA  25.47 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3947  TnsA endonuclease  26.85 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0222  TnsA endonuclease  26.28 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.262078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3828  transposon Tn7 transposition protein TnsA  28.22 
 
 		 275 aa  54.3  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3996  TnsA endonuclease  27.55 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5195  TnsA endonuclease  26.98 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3949  TnsA endonuclease  28.12 
 
 		 276 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0182  Tn7-like transposition protein A  24.66 
 
 		 277 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1876  Tn7-like transposition protein A  23.47 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2932  transposase  24.66 
 
 		 271 aa  46.2  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4327  Tn7-like transposition protein A  24.39 
 
 		 275 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2205  transposase  34.67 
 
 		 107 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>