28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2932 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2932  transposase  100 
 
 
271 aa  558  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3947  transposon Tn7 transposition protein TnsA  32.82 
 
 
275 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1201  Tn5468, transposase protein A  35.55 
 
 
276 aa  158  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4360  transposon Tn7 transposition protein TnsA  36.4 
 
 
273 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3199  Tn5468, transposase protein A  34.73 
 
 
278 aa  142  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2803  TnsA endonuclease  34.73 
 
 
288 aa  142  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3996  TnsA endonuclease  33.19 
 
 
276 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3947  TnsA endonuclease  33.19 
 
 
276 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3949  TnsA endonuclease  30.67 
 
 
276 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0222  TnsA endonuclease  35.66 
 
 
281 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.262078  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3828  transposon Tn7 transposition protein TnsA  32.53 
 
 
275 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0182  Tn7-like transposition protein A  30.17 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3486  Tn7-like transposition protein A  30.47 
 
 
272 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696924  normal  0.106668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2327  TnsA endonuclease  31.4 
 
 
276 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000207972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5725  hypothetical protein  36.24 
 
 
295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7027  TnsA endonuclease  32.14 
 
 
282 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1876  Tn7-like transposition protein A  31.45 
 
 
284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0174  Tn7-like transposition protein A  28.88 
 
 
279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5459  transposase Tn7-like proteinA  33.33 
 
 
317 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4327  Tn7-like transposition protein A  34.83 
 
 
275 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1117  Tn7-like transposition protein A  26.16 
 
 
281 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0245  TnsA endonuclease  27.12 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.534286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5195  TnsA endonuclease  34.98 
 
 
299 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3109  transposon Tn7 transposition protein A  33.99 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.201874 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2205  transposase  39.29 
 
 
107 aa  79  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6943  hypothetical protein  26.23 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.504828  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4969  transposon Tn7 transposition protein TnsA  29.58 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.230743  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1174  hypothetical protein  24.66 
 
 
307 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>