28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3199 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_3199  Tn5468, transposase protein A  100 
 
 		 278 aa  570  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2803  TnsA endonuclease  99.64 
 
 		 288 aa  568  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1201  Tn5468, transposase protein A  70.86 
 
 		 276 aa  411  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3486  Tn7-like transposition protein A  44.49 
 
 		 272 aa  236  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696924  normal  0.106668 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3996  TnsA endonuclease  42.86 
 
 		 276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3947  TnsA endonuclease  42.86 
 
 		 276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2327  TnsA endonuclease  42.11 
 
 		 276 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000207972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3949  TnsA endonuclease  42.8 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0174  Tn7-like transposition protein A  43.85 
 
 		 279 aa  202  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0182  Tn7-like transposition protein A  40.78 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3828  transposon Tn7 transposition protein TnsA  40.54 
 
 		 275 aa  192  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1876  Tn7-like transposition protein A  39.77 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1117  Tn7-like transposition protein A  35.79 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0222  TnsA endonuclease  46.22 
 
 		 281 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.262078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3947  transposon Tn7 transposition protein TnsA  36.72 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4360  transposon Tn7 transposition protein TnsA  37.6 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0245  TnsA endonuclease  36.29 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.534286 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7027  TnsA endonuclease  35.44 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5725  hypothetical protein  36.25 
 
 		 295 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2932  transposase  34.73 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5195  TnsA endonuclease  39.68 
 
 		 299 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4327  Tn7-like transposition protein A  37.04 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2205  transposase  48.54 
 
 		 107 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5459  transposase Tn7-like proteinA  29.88 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6943  hypothetical protein  28.8 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.504828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4969  transposon Tn7 transposition protein TnsA  28.97 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.230743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3109  transposon Tn7 transposition protein A  31.72 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.201874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1174  hypothetical protein  29.59 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>