27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5459 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5459  transposase Tn7-like proteinA  100 
 
 		 317 aa  654    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0182  Tn7-like transposition protein A  31.17 
 
 		 277 aa  116  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3996  TnsA endonuclease  27.95 
 
 		 276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3947  TnsA endonuclease  27.71 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1117  Tn7-like transposition protein A  28.25 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3947  transposon Tn7 transposition protein TnsA  30.95 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2932  transposase  33.33 
 
 		 271 aa  106  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1201  Tn5468, transposase protein A  31.76 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5725  hypothetical protein  38.24 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3486  Tn7-like transposition protein A  26.91 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696924  normal  0.106668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2327  TnsA endonuclease  32.96 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000207972 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4360  transposon Tn7 transposition protein TnsA  31.15 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3949  TnsA endonuclease  28.98 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3828  transposon Tn7 transposition protein TnsA  31.12 
 
 		 275 aa  103  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3199  Tn5468, transposase protein A  29.88 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2803  TnsA endonuclease  29.88 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5195  TnsA endonuclease  32.85 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4327  Tn7-like transposition protein A  30.61 
 
 		 275 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1876  Tn7-like transposition protein A  27.6 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7027  TnsA endonuclease  33.71 
 
 		 282 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0222  TnsA endonuclease  30.77 
 
 		 281 aa  89  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.262078  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0174  Tn7-like transposition protein A  28.51 
 
 		 279 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2205  transposase  38.79 
 
 		 107 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4969  transposon Tn7 transposition protein TnsA  31.58 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.230743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0245  TnsA endonuclease  31.68 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.534286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3109  transposon Tn7 transposition protein A  30 
 
 		 266 aa  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.201874 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6943  hypothetical protein  31.53 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.504828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>