28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1201 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1201  Tn5468, transposase protein A  100 
 
 
276 aa  565  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3199  Tn5468, transposase protein A  70.86 
 
 
278 aa  411  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2803  TnsA endonuclease  70.5 
 
 
288 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3996  TnsA endonuclease  44.88 
 
 
276 aa  225  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3486  Tn7-like transposition protein A  43.66 
 
 
272 aa  224  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696924  normal  0.106668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3947  TnsA endonuclease  44.88 
 
 
276 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2327  TnsA endonuclease  42.86 
 
 
276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000207972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0182  Tn7-like transposition protein A  41.39 
 
 
277 aa  208  8e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3949  TnsA endonuclease  48.58 
 
 
276 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0174  Tn7-like transposition protein A  45 
 
 
279 aa  201  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0222  TnsA endonuclease  47.6 
 
 
281 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.262078  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1876  Tn7-like transposition protein A  38.19 
 
 
284 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3828  transposon Tn7 transposition protein TnsA  37.8 
 
 
275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1117  Tn7-like transposition protein A  36.64 
 
 
281 aa  179  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4360  transposon Tn7 transposition protein TnsA  38.13 
 
 
273 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3947  transposon Tn7 transposition protein TnsA  36.07 
 
 
275 aa  168  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2932  transposase  35.55 
 
 
271 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0245  TnsA endonuclease  37.07 
 
 
276 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.534286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5725  hypothetical protein  34.32 
 
 
295 aa  139  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7027  TnsA endonuclease  43.18 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4327  Tn7-like transposition protein A  41.71 
 
 
275 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5195  TnsA endonuclease  37.84 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2205  transposase  47.57 
 
 
107 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5459  transposase Tn7-like proteinA  31.76 
 
 
317 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4969  transposon Tn7 transposition protein TnsA  29.6 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.230743  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6943  hypothetical protein  26.34 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.504828  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1174  hypothetical protein  28.79 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3109  transposon Tn7 transposition protein A  28.97 
 
 
266 aa  56.2  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.201874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>