23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4969 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4969  transposon Tn7 transposition protein TnsA  100 
 
 
273 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.230743  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4360  transposon Tn7 transposition protein TnsA  30.96 
 
 
273 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3828  transposon Tn7 transposition protein TnsA  30.04 
 
 
275 aa  88.2  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3199  Tn5468, transposase protein A  29.07 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2803  TnsA endonuclease  29.07 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1201  Tn5468, transposase protein A  29.41 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5459  transposase Tn7-like proteinA  31.58 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3947  transposon Tn7 transposition protein TnsA  25.98 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3949  TnsA endonuclease  26.97 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3947  TnsA endonuclease  26.36 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3996  TnsA endonuclease  26.73 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2932  transposase  29.58 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0182  Tn7-like transposition protein A  28.39 
 
 
277 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5725  hypothetical protein  28.09 
 
 
295 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1117  Tn7-like transposition protein A  22.98 
 
 
281 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0222  TnsA endonuclease  32.16 
 
 
281 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.262078  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2327  TnsA endonuclease  24.87 
 
 
276 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000207972 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2205  transposase  36.36 
 
 
107 aa  59.7  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3486  Tn7-like transposition protein A  24.18 
 
 
272 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696924  normal  0.106668 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1876  Tn7-like transposition protein A  19.79 
 
 
284 aa  53.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5195  TnsA endonuclease  25.14 
 
 
299 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0174  Tn7-like transposition protein A  28.83 
 
 
279 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7027  TnsA endonuclease  24.57 
 
 
282 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.869886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>