28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1117 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1117  Tn7-like transposition protein A  100 
 
 		 281 aa  578  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1876  Tn7-like transposition protein A  53.68 
 
 		 284 aa  295  6e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3486  Tn7-like transposition protein A  41.7 
 
 		 272 aa  236  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696924  normal  0.106668 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3996  TnsA endonuclease  42.44 
 
 		 276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3947  TnsA endonuclease  42.8 
 
 		 276 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2327  TnsA endonuclease  43.54 
 
 		 276 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000207972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0182  Tn7-like transposition protein A  40.31 
 
 		 277 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0174  Tn7-like transposition protein A  43.77 
 
 		 279 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3199  Tn5468, transposase protein A  35.79 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2803  TnsA endonuclease  35.42 
 
 		 288 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3949  TnsA endonuclease  36.19 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1201  Tn5468, transposase protein A  36.64 
 
 		 276 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3947  transposon Tn7 transposition protein TnsA  33.07 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3828  transposon Tn7 transposition protein TnsA  34.87 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0222  TnsA endonuclease  31.54 
 
 		 281 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.262078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0245  TnsA endonuclease  35.74 
 
 		 276 aa  146  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.534286 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7027  TnsA endonuclease  31.52 
 
 		 282 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4360  transposon Tn7 transposition protein TnsA  29.79 
 
 		 273 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5725  hypothetical protein  33.93 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5459  transposase Tn7-like proteinA  28.25 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5195  TnsA endonuclease  32.62 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2205  transposase  52.94 
 
 		 107 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4327  Tn7-like transposition protein A  30.38 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2932  transposase  26.16 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6943  hypothetical protein  23.6 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.504828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4969  transposon Tn7 transposition protein TnsA  22.89 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.230743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1174  hypothetical protein  23.19 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3109  transposon Tn7 transposition protein A  22.01 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.201874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>