24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3109 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3109  transposon Tn7 transposition protein A  100 
 
 		 266 aa  555  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.201874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2932  transposase  33.99 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5195  TnsA endonuclease  29.24 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0222  TnsA endonuclease  32.75 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.262078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4327  Tn7-like transposition protein A  31.41 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0245  TnsA endonuclease  32.41 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.534286 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7027  TnsA endonuclease  28.63 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5459  transposase Tn7-like proteinA  30 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2327  TnsA endonuclease  30.32 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000207972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3949  TnsA endonuclease  28.32 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3199  Tn5468, transposase protein A  31.72 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2803  TnsA endonuclease  31.72 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3996  TnsA endonuclease  28.39 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4360  transposon Tn7 transposition protein TnsA  31.01 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3486  Tn7-like transposition protein A  30.77 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696924  normal  0.106668 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5725  hypothetical protein  25.99 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3947  TnsA endonuclease  28.39 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0182  Tn7-like transposition protein A  29.61 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1201  Tn5468, transposase protein A  28.97 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3947  transposon Tn7 transposition protein TnsA  27.78 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1876  Tn7-like transposition protein A  24.44 
 
 		 284 aa  52  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3828  transposon Tn7 transposition protein TnsA  29.3 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0174  Tn7-like transposition protein A  24.83 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1117  Tn7-like transposition protein A  22.01 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>