66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0400 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0400  thymidylate synthase complementing protein ThyX  100 
 
 		 338 aa  697    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0173  thymidylate synthase, flavin-dependent  38 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000307587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2482  thymidylate synthase complementing protein ThyX  39.84 
 
 		 232 aa  87.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000421387  hitchhiker  0.00846096 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2353  thymidylate synthase complementing protein ThyX  36.96 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.431052  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3494  thymidylate synthase, flavin-dependent  36.15 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1744  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.33 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246329  normal  0.887681 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1265  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.85 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25280  FAD-dependent thymidylate synthase  31.11 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0348718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1279  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.85 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3547  FAD-dependent thymidylate synthase  32.12 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.583534  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4001  FAD-dependent thymidylate synthase  33.33 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0999655 
 
 
-
 
NC_002936  DET1489  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.82 
 
 		 195 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4274  thymidylate synthase flavin-dependent  31.25 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.933149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2189  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.77 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12767  FAD-dependent thymidylate synthase  31.03 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2386  FAD-dependent thymidylate synthase  32.58 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5811  FAD-dependent thymidylate synthase  31.39 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0523  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.69 
 
 		 237 aa  62  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1195  FAD-dependent thymidylate synthase  31.78 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200813  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20020  thymidylate synthase (FAD)  33.83 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1625  thymidylate synthase, flavin-dependent  34.65 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00115057  normal  0.386894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2236  FAD-dependent thymidylate synthase  28.87 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000477574  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09250  thymidylate synthase (FAD)  32.33 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0981097  normal  0.0643636 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2161  FAD-dependent thymidylate synthase  31.58 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298336  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2102  FAD-dependent thymidylate synthase  31.58 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2115  FAD-dependent thymidylate synthase  31.58 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1388  FAD-dependent thymidylate synthase  28.57 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0195  FAD-dependent thymidylate synthase  31.06 
 
 		 246 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00699129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3106  FAD-dependent thymidylate synthase  29.92 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0378  FAD-dependent thymidylate synthase  30.47 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000606523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1346  FAD-dependent thymidylate synthase  28.57 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2401  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2693  FAD-dependent thymidylate synthase  28.12 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000328347  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4063  FAD-dependent thymidylate synthase  28.06 
 
 		 229 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000544981  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3806  FAD-dependent thymidylate synthase  29.69 
 
 		 229 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0802  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.26 
 
 		 218 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3711  FAD-dependent thymidylate synthase  28.06 
 
 		 229 aa  53.5  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000128726  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2044  FAD-dependent thymidylate synthase  29.29 
 
 		 263 aa  53.1  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000390103  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2649  FAD-dependent thymidylate synthase  29.63 
 
 		 245 aa  53.1  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000329367  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0819  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.29 
 
 		 231 aa  52.8  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000230738  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1128  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.32 
 
 		 226 aa  49.3  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.307637  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2633  thymidylate synthase (FAD)  28.57 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0928647  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1148  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.8 
 
 		 267 aa  49.3  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.606793 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1027  FAD-dependent thymidylate synthase  27.69 
 
 		 230 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00194248  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2031  FAD-dependent thymidylate synthase  25.33 
 
 		 191 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.025295  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0366  FAD-dependent thymidylate synthase  24.18 
 
 		 239 aa  47  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02661  FAD-dependent thymidylate synthase  24.67 
 
 		 210 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.314215  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0919  thymidylate synthase complementing protein ThyX  28.22 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02761  FAD-dependent thymidylate synthase  25 
 
 		 212 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.990292  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02651  FAD-dependent thymidylate synthase  25 
 
 		 210 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0400  FAD-dependent thymidylate synthase  28.06 
 
 		 234 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037909  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0245  FAD-dependent thymidylate synthase  25 
 
 		 210 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2735  FAD-dependent thymidylate synthase  25.83 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0404  FAD-dependent thymidylate synthase  24.84 
 
 		 217 aa  44.3  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0189  FAD-dependent thymidylate synthase  27.13 
 
 		 245 aa  43.9  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.125611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1200  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.21 
 
 		 223 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.001686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00980  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.68 
 
 		 228 aa  43.5  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221907  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2383  FAD-dependent thymidylate synthase  23.13 
 
 		 216 aa  43.5  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1268  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.91 
 
 		 273 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908128  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1199  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.91 
 
 		 273 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1139  thymidylate synthase (FAD)  27.91 
 
 		 282 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.421298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2038  FAD-dependent thymidylate synthase  26.39 
 
 		 220 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2421  FAD-dependent thymidylate synthase  26.57 
 
 		 245 aa  42.7  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0588955  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0772  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.29 
 
 		 258 aa  42.7  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0028  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.32 
 
 		 281 aa  42.7  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1609  FAD-dependent thymidylate synthase  24.82 
 
 		 212 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03211  FAD-dependent thymidylate synthase  24.82 
 
 		 212 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>