69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0919 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0919  thymidylate synthase complementing protein ThyX  100 
 
 		 324 aa  666    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0508  thymidylate synthase complementing protein ThyX  40.37 
 
 		 289 aa  222  6e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2044  FAD-dependent thymidylate synthase  35.88 
 
 		 263 aa  89  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000390103  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3206  FAD-dependent thymidylate synthase  32.93 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2321  FAD-dependent thymidylate synthase  33.33 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294658  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2386  FAD-dependent thymidylate synthase  30.77 
 
 		 250 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0400  FAD-dependent thymidylate synthase  31.93 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037909  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0819  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.08 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000230738  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20020  thymidylate synthase (FAD)  31.4 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0523  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.13 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2421  FAD-dependent thymidylate synthase  28.83 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0588955  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4001  FAD-dependent thymidylate synthase  32.08 
 
 		 250 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0999655 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2735  FAD-dependent thymidylate synthase  28.83 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3806  FAD-dependent thymidylate synthase  31.87 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2189  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.45 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3711  FAD-dependent thymidylate synthase  31.87 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000128726  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1128  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.23 
 
 		 226 aa  72.4  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.307637  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0990  FAD-dependent thymidylate synthase  33.13 
 
 		 245 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329805  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0772  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.29 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12767  FAD-dependent thymidylate synthase  30.82 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0378  FAD-dependent thymidylate synthase  30.63 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000606523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2693  FAD-dependent thymidylate synthase  30 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000328347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2161  FAD-dependent thymidylate synthase  30.95 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298336  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2102  FAD-dependent thymidylate synthase  30.95 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2115  FAD-dependent thymidylate synthase  30.95 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1027  FAD-dependent thymidylate synthase  29.27 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00194248  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09250  thymidylate synthase (FAD)  29.34 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0981097  normal  0.0643636 
 
 
-
 
NC_002936  DET1489  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.76 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0802  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.27 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4063  FAD-dependent thymidylate synthase  29.48 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000544981  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2649  FAD-dependent thymidylate synthase  27.65 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000329367  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3106  FAD-dependent thymidylate synthase  31.71 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25280  FAD-dependent thymidylate synthase  30.82 
 
 		 250 aa  67  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0348718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0028  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.02 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1279  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.17 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5811  FAD-dependent thymidylate synthase  29.88 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4274  thymidylate synthase flavin-dependent  28.83 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.933149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1265  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.4 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1200  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.54 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.001686  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3547  FAD-dependent thymidylate synthase  29.82 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.583534  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00980  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.52 
 
 		 228 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221907  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1882  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.47 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0694605  normal  0.133921 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2890  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.59 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1187  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.53 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.933104 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1297  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.99 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1894  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.91 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1199  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.3 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1268  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.3 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0195  FAD-dependent thymidylate synthase  29.44 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00699129  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1139  thymidylate synthase (FAD)  30.3 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.421298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3898  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.33 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.262304 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.14 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1388  FAD-dependent thymidylate synthase  28.22 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1346  FAD-dependent thymidylate synthase  28.22 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2401  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1195  FAD-dependent thymidylate synthase  29.45 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200813  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2236  FAD-dependent thymidylate synthase  28.57 
 
 		 233 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000477574  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0189  FAD-dependent thymidylate synthase  26.63 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.125611  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2792  FAD-dependent thymidylate synthase  27.65 
 
 		 285 aa  50.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3813  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  29.07 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17838  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2633  thymidylate synthase (FAD)  30.25 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0928647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3530  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  29.07 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537663  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3445  thymidylate synthase  28.9 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3449  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.49 
 
 		 248 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354216  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0400  thymidylate synthase complementing protein ThyX  28.22 
 
 		 338 aa  45.8  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02661  FAD-dependent thymidylate synthase  28.83 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.314215  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0245  FAD-dependent thymidylate synthase  29.01 
 
 		 210 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02651  FAD-dependent thymidylate synthase  28.22 
 
 		 210 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2038  FAD-dependent thymidylate synthase  26.54 
 
 		 220 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0001  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.99 
 
 		 204 aa  42.7  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.248117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>