69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3696 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1156  feruloyl esterase  65.28 
 
 
578 aa  810    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3386  tannase and feruloyl esterase  62.46 
 
 
578 aa  778    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.866711  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3696  feruloyl esterase  100 
 
 
576 aa  1198    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663384  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5482  Tannase and feruloyl esterase  54.24 
 
 
597 aa  573  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4538  tannase and feruloyl esterase  52.1 
 
 
569 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.689604  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2927  tannase and feruloyl esterase  49.4 
 
 
579 aa  561  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.146406  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4018  Feruloyl esterase  50.81 
 
 
577 aa  549  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000882838  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4911  feruloyl esterase  49.13 
 
 
573 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591571  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5459  feruloyl esterase  48.89 
 
 
573 aa  548  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.827658  normal  0.315232 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4598  feruloyl esterase  49.11 
 
 
574 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.517638  hitchhiker  0.000228808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5631  feruloyl esterase  48.93 
 
 
574 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.967793  decreased coverage  0.00150641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5228  feruloyl esterase  48.93 
 
 
574 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172449  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0055  feruloyl esterase  48.61 
 
 
573 aa  538  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.980773  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4873  feruloyl esterase  49.73 
 
 
587 aa  537  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24063  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3219  tannase and feruloyl esterase  49.73 
 
 
572 aa  529  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.084754 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1073  tannase/feruloyl esterase family protein  47.68 
 
 
574 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2366  chlorogenate esterase  48.16 
 
 
563 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421643  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1795  chlorogenate esterase  47.5 
 
 
574 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136386  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0831  chlorogenate esterase  47.5 
 
 
574 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0634  chlorogenate esterase  47.5 
 
 
574 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5301  putative feruloyl esterase  44.72 
 
 
559 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0117513 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0094  tannase and feruloyl esterase  39.68 
 
 
553 aa  368  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3196  putative feruloyl esterase  38.53 
 
 
554 aa  350  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1909  hypothetical protein  39.81 
 
 
556 aa  349  7e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3533  feruloyl esterase  35 
 
 
564 aa  328  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0148594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0245  Tannase and feruloyl esterase  36.56 
 
 
560 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267882 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1906  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.07 
 
 
514 aa  283  6.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.18678  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6036  feruloyl esterase  28.76 
 
 
606 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104543  normal  0.114417 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7567  feruloyl esterase  28.33 
 
 
602 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00440654  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2711  putative feruloyl esterase  29.12 
 
 
555 aa  188  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0128  feruloyl esterase  28.72 
 
 
571 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0593  feruloyl esterase  27.23 
 
 
552 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2863  feruloyl esterase  29.34 
 
 
579 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00992534  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1752  Tannase and feruloyl esterase  28.02 
 
 
566 aa  177  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461112  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3044  feruloyl esterase  28.72 
 
 
476 aa  174  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0953377  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2982  hypothetical protein  28.4 
 
 
576 aa  173  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.444016  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3537  tannase and feruloyl esterase  27.12 
 
 
553 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2279  feruloyl esterase  28.51 
 
 
556 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.480724 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1150  chlorogenate esterase  49.06 
 
 
251 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.873384  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3841  tannase and feruloyl esterase (alpha/beta hydrolase family)  28.75 
 
 
604 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.943926  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6047  Feruloyl esterase  27.88 
 
 
556 aa  162  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363794  normal  0.322445 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1290  putative tannase and feruloyl esterase  26.72 
 
 
575 aa  158  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4357  tannase and feruloyl esterase  26.68 
 
 
570 aa  157  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4845  Tannase and feruloyl esterase  27.29 
 
 
552 aa  154  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1509  tannase and feruloyl esterase  26.48 
 
 
581 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5786  tannase and feruloyl esterase  26.84 
 
 
562 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01772  feruloyl esterase, type B (Eurofung)  27.07 
 
 
527 aa  140  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342481  normal  0.54354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3266  tannase and feruloyl esterase  25.09 
 
 
572 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6149  Feruloyl esterase  27.85 
 
 
546 aa  138  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04040  feruloyl esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00960)  25.51 
 
 
523 aa  136  9e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6029  tannase and feruloyl esterase  27.05 
 
 
562 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.975133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7130  Tannase  25.43 
 
 
555 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000264682  normal  0.294319 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3251  tannase and feruloyl esterase  26.53 
 
 
565 aa  134  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6136  feruloyl esterase  27.22 
 
 
615 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.640276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0081  Tannase and feruloyl esterase  26.24 
 
 
636 aa  130  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369493  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6529  feruloyl esterase  26.38 
 
 
615 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1301  feruloyl esterase  26.38 
 
 
615 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288361  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5946  tannase and feruloyl esterase  25.79 
 
 
572 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2115  putative chlorogenate esterase  38.07 
 
 
235 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1578  tannase and feruloyl esterase  25.66 
 
 
566 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374463  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6287  Tannase and feruloyl esterase  24.11 
 
 
609 aa  112  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000676989  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09203  tannase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03470)  24.58 
 
 
593 aa  111  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02697  conserved hypothetical protein  24.4 
 
 
584 aa  107  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00153901  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2302  Tannase and feruloyl esterase  23.23 
 
 
610 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125743  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07213  conserved hypothetical protein  23.35 
 
 
559 aa  103  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8517  hypothetical protein  29.7 
 
 
463 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236902  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2345  LigA  26.41 
 
 
490 aa  47.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.800961  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31720  hypothetical protein  28.68 
 
 
457 aa  43.9  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0239  hypothetical protein  26.02 
 
 
411 aa  43.9  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.780841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>