66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1909 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1909  hypothetical protein  100 
 
 
556 aa  1140    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0094  tannase and feruloyl esterase  49.34 
 
 
553 aa  530  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5301  putative feruloyl esterase  49.04 
 
 
559 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0117513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4018  Feruloyl esterase  42.94 
 
 
577 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000882838  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4911  feruloyl esterase  41.36 
 
 
573 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591571  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4598  feruloyl esterase  41.55 
 
 
574 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.517638  hitchhiker  0.000228808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0055  feruloyl esterase  41.75 
 
 
573 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.980773  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3219  tannase and feruloyl esterase  42.02 
 
 
572 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.084754 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5631  feruloyl esterase  40.97 
 
 
574 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.967793  decreased coverage  0.00150641 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5459  feruloyl esterase  40.93 
 
 
573 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.827658  normal  0.315232 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5228  feruloyl esterase  40.97 
 
 
574 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172449  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1073  tannase/feruloyl esterase family protein  40.43 
 
 
574 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3386  tannase and feruloyl esterase  38.77 
 
 
578 aa  364  2e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.866711  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5482  Tannase and feruloyl esterase  41.1 
 
 
597 aa  363  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2366  chlorogenate esterase  40.25 
 
 
563 aa  363  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421643  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1795  chlorogenate esterase  40.25 
 
 
574 aa  363  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136386  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0831  chlorogenate esterase  40.25 
 
 
574 aa  363  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0634  chlorogenate esterase  40.25 
 
 
574 aa  363  6e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1156  feruloyl esterase  38.7 
 
 
578 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4873  feruloyl esterase  41.44 
 
 
587 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24063  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3696  feruloyl esterase  39.81 
 
 
576 aa  349  7e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663384  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2927  tannase and feruloyl esterase  38.16 
 
 
579 aa  347  3e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.146406  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4538  tannase and feruloyl esterase  39.74 
 
 
569 aa  340  5e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.689604  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0245  Tannase and feruloyl esterase  36.9 
 
 
560 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3196  putative feruloyl esterase  36.98 
 
 
554 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3533  feruloyl esterase  36.27 
 
 
564 aa  294  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0148594 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1906  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.13 
 
 
514 aa  291  2e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.18678  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6036  feruloyl esterase  27.72 
 
 
606 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104543  normal  0.114417 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7567  feruloyl esterase  27.69 
 
 
602 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00440654  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3044  feruloyl esterase  29.77 
 
 
476 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0953377  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2863  feruloyl esterase  26.74 
 
 
579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00992534  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1290  putative tannase and feruloyl esterase  29.76 
 
 
575 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0593  feruloyl esterase  28.88 
 
 
552 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2711  putative feruloyl esterase  28.52 
 
 
555 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1752  Tannase and feruloyl esterase  28.52 
 
 
566 aa  156  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461112  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2982  hypothetical protein  27.85 
 
 
576 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.444016  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3537  tannase and feruloyl esterase  29.14 
 
 
553 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6149  Feruloyl esterase  30.24 
 
 
546 aa  146  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3841  tannase and feruloyl esterase (alpha/beta hydrolase family)  28.4 
 
 
604 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.943926  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6029  tannase and feruloyl esterase  28.62 
 
 
562 aa  143  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.975133  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1509  tannase and feruloyl esterase  26.64 
 
 
581 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4845  Tannase and feruloyl esterase  28.99 
 
 
552 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5786  tannase and feruloyl esterase  27.79 
 
 
562 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4357  tannase and feruloyl esterase  28.24 
 
 
570 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3251  tannase and feruloyl esterase  28.49 
 
 
565 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6047  Feruloyl esterase  26.27 
 
 
556 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363794  normal  0.322445 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1150  chlorogenate esterase  43.79 
 
 
251 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.873384  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2279  feruloyl esterase  25.17 
 
 
556 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.480724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1578  tannase and feruloyl esterase  27.6 
 
 
566 aa  125  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374463  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0128  feruloyl esterase  25.39 
 
 
571 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5946  tannase and feruloyl esterase  29.12 
 
 
572 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7130  Tannase  25.44 
 
 
555 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000264682  normal  0.294319 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02697  conserved hypothetical protein  22.37 
 
 
584 aa  103  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00153901  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01772  feruloyl esterase, type B (Eurofung)  23.98 
 
 
527 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342481  normal  0.54354 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04040  feruloyl esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00960)  24.95 
 
 
523 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09203  tannase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03470)  20.93 
 
 
593 aa  97.4  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3266  tannase and feruloyl esterase  27.86 
 
 
572 aa  96.7  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07213  conserved hypothetical protein  24.67 
 
 
559 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6287  Tannase and feruloyl esterase  25.61 
 
 
609 aa  79.7  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000676989  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2115  putative chlorogenate esterase  33.33 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2302  Tannase and feruloyl esterase  25.7 
 
 
610 aa  65.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125743  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0081  Tannase and feruloyl esterase  24.04 
 
 
636 aa  63.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369493  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6136  feruloyl esterase  28.76 
 
 
615 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.640276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1301  feruloyl esterase  28.1 
 
 
615 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288361  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6529  feruloyl esterase  28.1 
 
 
615 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2345  LigA  30.5 
 
 
490 aa  43.9  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.800961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>