67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4357 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_4357  tannase and feruloyl esterase  100 
 
 
570 aa  1155    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1509  tannase and feruloyl esterase  58.44 
 
 
581 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1290  putative tannase and feruloyl esterase  57.95 
 
 
575 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3251  tannase and feruloyl esterase  50.56 
 
 
565 aa  502  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4845  Tannase and feruloyl esterase  52.25 
 
 
552 aa  501  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3537  tannase and feruloyl esterase  43.58 
 
 
553 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5786  tannase and feruloyl esterase  40.33 
 
 
562 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6029  tannase and feruloyl esterase  41.07 
 
 
562 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.975133  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5946  tannase and feruloyl esterase  38.36 
 
 
572 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1752  Tannase and feruloyl esterase  40.77 
 
 
566 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461112  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0128  feruloyl esterase  36.92 
 
 
571 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2279  feruloyl esterase  38.5 
 
 
556 aa  302  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.480724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6047  Feruloyl esterase  38.22 
 
 
556 aa  295  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363794  normal  0.322445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2711  putative feruloyl esterase  35.14 
 
 
555 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3266  tannase and feruloyl esterase  32.99 
 
 
572 aa  249  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6149  Feruloyl esterase  34.28 
 
 
546 aa  214  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3533  feruloyl esterase  31.41 
 
 
564 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0148594 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1906  flagellar biosynthetic protein FliQ  29.45 
 
 
514 aa  189  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.18678  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0245  Tannase and feruloyl esterase  30.45 
 
 
560 aa  182  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0593  feruloyl esterase  30.66 
 
 
552 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5459  feruloyl esterase  29.52 
 
 
573 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.827658  normal  0.315232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5301  putative feruloyl esterase  29.66 
 
 
559 aa  179  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0117513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4911  feruloyl esterase  29.06 
 
 
573 aa  178  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591571  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0055  feruloyl esterase  29.53 
 
 
573 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.980773  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5631  feruloyl esterase  28.69 
 
 
574 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.967793  decreased coverage  0.00150641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5228  feruloyl esterase  28.69 
 
 
574 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172449  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4598  feruloyl esterase  28.52 
 
 
574 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.517638  hitchhiker  0.000228808 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1073  tannase/feruloyl esterase family protein  31.23 
 
 
574 aa  171  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1578  tannase and feruloyl esterase  31.96 
 
 
566 aa  170  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374463  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0831  chlorogenate esterase  31.05 
 
 
574 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2366  chlorogenate esterase  31.05 
 
 
563 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421643  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0634  chlorogenate esterase  31.05 
 
 
574 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1795  chlorogenate esterase  31.05 
 
 
574 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136386  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2927  tannase and feruloyl esterase  25.88 
 
 
579 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.146406  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3696  feruloyl esterase  26.88 
 
 
576 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663384  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3219  tannase and feruloyl esterase  28.55 
 
 
572 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.084754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3196  putative feruloyl esterase  30.34 
 
 
554 aa  160  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4018  Feruloyl esterase  28.09 
 
 
577 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000882838  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4538  tannase and feruloyl esterase  27.87 
 
 
569 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.689604  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7567  feruloyl esterase  30.02 
 
 
602 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00440654  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2863  feruloyl esterase  30.96 
 
 
579 aa  158  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00992534  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1156  feruloyl esterase  27.02 
 
 
578 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4873  feruloyl esterase  27.26 
 
 
587 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24063  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2982  hypothetical protein  30.16 
 
 
576 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.444016  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6036  feruloyl esterase  30.48 
 
 
606 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104543  normal  0.114417 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5482  Tannase and feruloyl esterase  29.44 
 
 
597 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0094  tannase and feruloyl esterase  26.76 
 
 
553 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3386  tannase and feruloyl esterase  25.65 
 
 
578 aa  147  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.866711  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1909  hypothetical protein  28.75 
 
 
556 aa  144  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01772  feruloyl esterase, type B (Eurofung)  25.38 
 
 
527 aa  140  7.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342481  normal  0.54354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0081  Tannase and feruloyl esterase  28.72 
 
 
636 aa  136  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369493  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3841  tannase and feruloyl esterase (alpha/beta hydrolase family)  26.64 
 
 
604 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.943926  normal  0.479863 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04040  feruloyl esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00960)  27.8 
 
 
523 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7130  Tannase  26.92 
 
 
555 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000264682  normal  0.294319 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3044  feruloyl esterase  28.48 
 
 
476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0953377  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6287  Tannase and feruloyl esterase  27.13 
 
 
609 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000676989  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6529  feruloyl esterase  24.39 
 
 
615 aa  97.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1301  feruloyl esterase  24.39 
 
 
615 aa  97.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288361  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6136  feruloyl esterase  24.77 
 
 
615 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.640276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2115  putative chlorogenate esterase  34.62 
 
 
235 aa  94.7  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07213  conserved hypothetical protein  25 
 
 
559 aa  92.8  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09203  tannase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03470)  23.78 
 
 
593 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1150  chlorogenate esterase  36.67 
 
 
251 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.873384  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2302  Tannase and feruloyl esterase  32.7 
 
 
610 aa  74.7  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125743  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07394  conserved hypothetical protein  30.22 
 
 
329 aa  63.9  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.164986 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02697  conserved hypothetical protein  24.48 
 
 
584 aa  63.5  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00153901  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09264  conserved hypothetical protein  31.91 
 
 
202 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0956952  normal  0.404079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>